145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1770 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1770  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  952    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1708  hypothetical protein  98.92 
 
 		 464 aa  943    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01319  decarboxylase family protein  75.33 
 
 		 461 aa  690    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12391  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1377  hypothetical protein  75.43 
 
 		 462 aa  714    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.152492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1809  hypothetical protein  60.67 
 
 		 454 aa  554  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3091  decarboxylase family protein  58.94 
 
 		 454 aa  543  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00268916  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3662  decarboxylase family protein  55.73 
 
 		 457 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358077  normal  0.251066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3302  hypothetical protein  56.33 
 
 		 457 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2067  hypothetical protein  55.73 
 
 		 457 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.841023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2241  hypothetical protein  55.51 
 
 		 457 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3498  hypothetical protein  54.95 
 
 		 468 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10730  hypothetical protein  55.48 
 
 		 461 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0422  hypothetical protein  55.29 
 
 		 457 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0977  hypothetical protein  55.26 
 
 		 461 aa  534  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1909  decarboxylase family protein  54.73 
 
 		 457 aa  528  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0510531  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27090  hypothetical protein  56.04 
 
 		 457 aa  530  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.649053  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1069  decarboxylase family protein  55.8 
 
 		 454 aa  522  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2241  hypothetical protein  54.39 
 
 		 457 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3650  hypothetical protein  55.95 
 
 		 460 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0695  hypothetical protein  53.91 
 
 		 452 aa  515  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.360136  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0421  hypothetical protein  53.71 
 
 		 457 aa  514  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.100113  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1290  hypothetical protein  54.26 
 
 		 451 aa  511  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.921441  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1550  hypothetical protein  54.48 
 
 		 451 aa  508  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2715  hypothetical protein  54.48 
 
 		 451 aa  508  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.715742  normal  0.0118371 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2783  hypothetical protein  54.48 
 
 		 451 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.241401  normal  0.0251261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1358  hypothetical protein  54.71 
 
 		 451 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2987  hypothetical protein  54.71 
 
 		 451 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000362342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1397  hypothetical protein  54.48 
 
 		 451 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.262603  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004247  decarboxylase family protein  55.13 
 
 		 458 aa  509  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1372  hypothetical protein  54.48 
 
 		 451 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3796  hypothetical protein  55.75 
 
 		 456 aa  504  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.024661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03047  hypothetical protein  55.83 
 
 		 454 aa  502  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0303345  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2885  hypothetical protein  54.04 
 
 		 451 aa  501  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01190  hypothetical protein  55.16 
 
 		 458 aa  495  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3801  hypothetical protein  54.44 
 
 		 454 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121315  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2775  hypothetical protein  53.79 
 
 		 454 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1882  hypothetical protein  52.88 
 
 		 457 aa  490  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000892818  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2775  hypothetical protein  51.22 
 
 		 450 aa  488  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3373  hypothetical protein  53.57 
 
 		 454 aa  488  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0931  hypothetical protein  53.78 
 
 		 454 aa  490  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3537  lysine decarboxylase family protein  53.91 
 
 		 448 aa  485  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3174  hypothetical protein  53.33 
 
 		 454 aa  487  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2557  hypothetical protein  54.91 
 
 		 451 aa  488  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3111  lysine decarboxylase family protein  53.57 
 
 		 454 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113256  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3248  hypothetical protein  52.9 
 
 		 454 aa  481  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.322877  normal  0.240176 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1003  putative decarboxylase  52.21 
 
 		 454 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0026607  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3310  hypothetical protein  54.48 
 
 		 450 aa  481  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029835 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3156  hypothetical protein  52.21 
 
 		 454 aa  484  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1056  hypothetical protein  52.21 
 
 		 454 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3192  lysine decarboxylase family protein  53.57 
 
 		 454 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3176  lysine decarboxylase family protein  53.57 
 
 		 454 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133947  normal  0.691033 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3129  lysine decarboxylase family protein  53.57 
 
 		 454 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.436667 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02640  hypothetical protein  53.35 
 
 		 454 aa  478  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02602  hypothetical protein  53.35 
 
 		 454 aa  478  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2419  hypothetical protein  54.71 
 
 		 451 aa  481  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4059  hypothetical protein  53.35 
 
 		 454 aa  478  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2755  hypothetical protein  53.71 
 
 		 450 aa  479  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0317572 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2939  hypothetical protein  53.35 
 
 		 454 aa  478  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.275577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3100  hypothetical protein  53.35 
 
 		 454 aa  478  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.484247  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3291  lysine decarboxylase family protein  53.35 
 
 		 454 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0917  hypothetical protein  53.35 
 
 		 454 aa  478  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3459  hypothetical protein  54.48 
 
 		 450 aa  478  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000318169 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2990  hypothetical protein  52.99 
 
 		 457 aa  478  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0893  conserved hypothetical protein  53.35 
 
 		 454 aa  478  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746871  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2975  hypothetical protein  54.46 
 
 		 450 aa  478  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.202766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2935  hypothetical protein  53.12 
 
 		 454 aa  478  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.153502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3077  hypothetical protein  53.12 
 
 		 454 aa  477  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.465683  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3194  hypothetical protein  52.8 
 
 		 451 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0850  hypothetical protein  51.12 
 
 		 460 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0350692  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  28.35 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  28.97 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3314  hypothetical protein  28.18 
 
 		 270 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3064  hypothetical protein  29.63 
 
 		 342 aa  56.6  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00713435  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0464  hypothetical protein  30.97 
 
 		 235 aa  55.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  27.66 
 
 		 245 aa  54.7  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1904  decarboxylase family protein  26.69 
 
 		 342 aa  54.7  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0178748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  25.23 
 
 		 255 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  30.4 
 
 		 225 aa  54.3  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1267  hypothetical protein  25.53 
 
 		 342 aa  53.5  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.13698e-16  decreased coverage  0.00000000000243562 
 
 
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  27.61 
 
 		 247 aa  53.1  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2520  hypothetical protein  32 
 
 		 236 aa  52.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.220081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  27.34 
 
 		 245 aa  52.8  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  30.17 
 
 		 243 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3710  hypothetical protein  25.21 
 
 		 351 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  32 
 
 		 249 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  26.7 
 
 		 266 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  29.41 
 
 		 313 aa  51.6  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  30.71 
 
 		 217 aa  51.2  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  27.42 
 
 		 264 aa  51.2  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2015  hypothetical protein  31.2 
 
 		 205 aa  51.2  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2800  hypothetical protein  30.15 
 
 		 275 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.983756  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  27.18 
 
 		 332 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  26.62 
 
 		 261 aa  50.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  29.63 
 
 		 289 aa  49.7  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  33.33 
 
 		 268 aa  50.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  25.97 
 
 		 260 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  31.75 
 
 		 263 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  26.28 
 
 		 273 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  28.08 
 
 		 266 aa  48.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  26.52 
 
 		 262 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>