148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1882 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1882  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  950    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000892818  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1809  hypothetical protein  55.58 
 
 		 454 aa  544  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3302  hypothetical protein  56 
 
 		 457 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3091  decarboxylase family protein  53.02 
 
 		 454 aa  519  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00268916  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1069  decarboxylase family protein  53.69 
 
 		 454 aa  521  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0422  hypothetical protein  54.79 
 
 		 457 aa  519  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1909  decarboxylase family protein  54.67 
 
 		 457 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0510531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3498  hypothetical protein  54.44 
 
 		 468 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27090  hypothetical protein  54 
 
 		 457 aa  514  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.649053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10730  hypothetical protein  53.67 
 
 		 461 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0695  hypothetical protein  52.9 
 
 		 452 aa  512  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.360136  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0977  hypothetical protein  53.45 
 
 		 461 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3662  decarboxylase family protein  53.56 
 
 		 457 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358077  normal  0.251066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2067  hypothetical protein  53.56 
 
 		 457 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.841023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2241  hypothetical protein  53.56 
 
 		 457 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1377  hypothetical protein  53.32 
 
 		 462 aa  504  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.152492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0421  hypothetical protein  52.9 
 
 		 457 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.100113  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2241  hypothetical protein  52.89 
 
 		 457 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004247  decarboxylase family protein  52.02 
 
 		 458 aa  501  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3650  hypothetical protein  50.98 
 
 		 460 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2775  hypothetical protein  51.34 
 
 		 450 aa  488  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2783  hypothetical protein  52.47 
 
 		 451 aa  485  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.241401  normal  0.0251261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1358  hypothetical protein  51.79 
 
 		 451 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2987  hypothetical protein  51.79 
 
 		 451 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000362342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1397  hypothetical protein  51.57 
 
 		 451 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.262603  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01319  decarboxylase family protein  51.99 
 
 		 461 aa  487  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12391  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1550  hypothetical protein  52.47 
 
 		 451 aa  483  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2715  hypothetical protein  52.24 
 
 		 451 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.715742  normal  0.0118371 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1372  hypothetical protein  51.57 
 
 		 451 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2885  hypothetical protein  52.24 
 
 		 451 aa  480  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1290  hypothetical protein  51.35 
 
 		 451 aa  479  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.921441  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3796  hypothetical protein  50.22 
 
 		 456 aa  476  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.024661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01190  hypothetical protein  51.9 
 
 		 458 aa  478  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03047  hypothetical protein  50.22 
 
 		 454 aa  473  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0303345  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3537  lysine decarboxylase family protein  50.9 
 
 		 448 aa  470  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2775  hypothetical protein  51.35 
 
 		 454 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2419  hypothetical protein  51.57 
 
 		 451 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3174  hypothetical protein  50.67 
 
 		 454 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1770  hypothetical protein  52.88 
 
 		 464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1708  hypothetical protein  53.1 
 
 		 464 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3176  lysine decarboxylase family protein  50.89 
 
 		 454 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133947  normal  0.691033 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2557  hypothetical protein  52.47 
 
 		 451 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3111  lysine decarboxylase family protein  50.89 
 
 		 454 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113256  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3129  lysine decarboxylase family protein  50.89 
 
 		 454 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3291  lysine decarboxylase family protein  50.89 
 
 		 454 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1003  putative decarboxylase  50.22 
 
 		 454 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0026607  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2990  hypothetical protein  50.99 
 
 		 457 aa  467  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3156  hypothetical protein  50.22 
 
 		 454 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1056  hypothetical protein  50.22 
 
 		 454 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3192  lysine decarboxylase family protein  50.89 
 
 		 454 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3248  hypothetical protein  50.44 
 
 		 454 aa  463  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.322877  normal  0.240176 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3801  hypothetical protein  50.22 
 
 		 454 aa  461  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121315  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3459  hypothetical protein  52.36 
 
 		 450 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000318169 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0931  hypothetical protein  50.89 
 
 		 454 aa  464  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02640  hypothetical protein  50.44 
 
 		 454 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0893  conserved hypothetical protein  50.44 
 
 		 454 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746871  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02602  hypothetical protein  50.44 
 
 		 454 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4059  hypothetical protein  50.44 
 
 		 454 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3373  hypothetical protein  50.44 
 
 		 454 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2755  hypothetical protein  50.11 
 
 		 450 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0317572 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2939  hypothetical protein  50.44 
 
 		 454 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.275577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3100  hypothetical protein  50.44 
 
 		 454 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.484247  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2975  hypothetical protein  52.02 
 
 		 450 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.202766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0917  hypothetical protein  50.44 
 
 		 454 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2935  hypothetical protein  50.44 
 
 		 454 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.153502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3077  hypothetical protein  50.67 
 
 		 454 aa  461  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.465683  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3310  hypothetical protein  50.56 
 
 		 450 aa  456  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029835 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3194  hypothetical protein  50.34 
 
 		 451 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0850  hypothetical protein  47.76 
 
 		 460 aa  436  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0350692  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  35.43 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  29.75 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  28.98 
 
 		 313 aa  56.6  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  28.9 
 
 		 259 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  26.83 
 
 		 225 aa  55.1  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  29.27 
 
 		 301 aa  53.5  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  30.99 
 
 		 220 aa  52.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  28.28 
 
 		 266 aa  53.1  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0164  hypothetical protein  25.94 
 
 		 242 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2800  hypothetical protein  29.31 
 
 		 275 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.983756  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  28.66 
 
 		 235 aa  51.2  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  25.43 
 
 		 245 aa  50.1  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  28.22 
 
 		 284 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  31.5 
 
 		 285 aa  49.3  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0555  hypothetical protein  26.32 
 
 		 241 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456463  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  28.86 
 
 		 243 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  28.79 
 
 		 287 aa  47.8  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  28.79 
 
 		 287 aa  47.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  28.24 
 
 		 261 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  29.69 
 
 		 251 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  28.97 
 
 		 315 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  23.15 
 
 		 247 aa  47.8  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  28.97 
 
 		 292 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  29.79 
 
 		 292 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  47.4  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3473  hypothetical protein  23.72 
 
 		 197 aa  47.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2015  hypothetical protein  28.85 
 
 		 205 aa  47.4  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0709  hypothetical protein  24.31 
 
 		 259 aa  46.2  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  29.79 
 
 		 318 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0476  hypothetical protein  26.45 
 
 		 218 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  29.55 
 
 		 175 aa  46.6  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>