144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2715 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1550  hypothetical protein  96.9 
 
 		 451 aa  907    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004247  decarboxylase family protein  68.44 
 
 		 458 aa  654    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2557  hypothetical protein  83.37 
 
 		 451 aa  785    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2715  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  931    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.715742  normal  0.0118371 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2783  hypothetical protein  99.78 
 
 		 451 aa  929    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.241401  normal  0.0251261 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2775  hypothetical protein  80.27 
 
 		 454 aa  770    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2885  hypothetical protein  98.23 
 
 		 451 aa  914    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2419  hypothetical protein  84.26 
 
 		 451 aa  781    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2987  hypothetical protein  90.91 
 
 		 451 aa  862    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000362342 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1372  hypothetical protein  90.69 
 
 		 451 aa  860    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2755  hypothetical protein  77.95 
 
 		 450 aa  742    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0317572 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1290  hypothetical protein  93.35 
 
 		 451 aa  875    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.921441  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0421  hypothetical protein  70.07 
 
 		 457 aa  666    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.100113  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1358  hypothetical protein  90.91 
 
 		 451 aa  862    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01190  hypothetical protein  69.11 
 
 		 458 aa  646    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3310  hypothetical protein  77.73 
 
 		 450 aa  741    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3801  hypothetical protein  67.55 
 
 		 454 aa  645    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121315  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2975  hypothetical protein  80.93 
 
 		 450 aa  767    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.202766  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1397  hypothetical protein  90.91 
 
 		 451 aa  863    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.262603  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3459  hypothetical protein  78.17 
 
 		 450 aa  735    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000318169 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3373  hypothetical protein  66 
 
 		 454 aa  631  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0695  hypothetical protein  64.67 
 
 		 452 aa  633  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.360136  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3176  lysine decarboxylase family protein  66 
 
 		 454 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133947  normal  0.691033 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3174  hypothetical protein  64.98 
 
 		 454 aa  628  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3111  lysine decarboxylase family protein  66 
 
 		 454 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113256  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3129  lysine decarboxylase family protein  66 
 
 		 454 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3192  lysine decarboxylase family protein  66 
 
 		 454 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0931  hypothetical protein  65.64 
 
 		 454 aa  631  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02640  hypothetical protein  66.15 
 
 		 454 aa  627  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02602  hypothetical protein  66.15 
 
 		 454 aa  627  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4059  hypothetical protein  66.15 
 
 		 454 aa  627  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3291  lysine decarboxylase family protein  66 
 
 		 454 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1003  putative decarboxylase  66.08 
 
 		 454 aa  626  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0026607  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2939  hypothetical protein  66.15 
 
 		 454 aa  627  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.275577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3100  hypothetical protein  66.15 
 
 		 454 aa  627  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.484247  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3156  hypothetical protein  66.08 
 
 		 454 aa  626  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1056  hypothetical protein  66.08 
 
 		 454 aa  626  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0917  hypothetical protein  66.15 
 
 		 454 aa  627  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2935  hypothetical protein  66.15 
 
 		 454 aa  626  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.153502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3077  hypothetical protein  65.93 
 
 		 454 aa  625  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.465683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0893  conserved hypothetical protein  65.93 
 
 		 454 aa  623  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746871  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3248  hypothetical protein  65.27 
 
 		 454 aa  622  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.322877  normal  0.240176 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2990  hypothetical protein  65.21 
 
 		 457 aa  622  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03047  hypothetical protein  62.19 
 
 		 454 aa  605  9.999999999999999e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0303345  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3091  decarboxylase family protein  62.89 
 
 		 454 aa  599  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00268916  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3537  lysine decarboxylase family protein  61.86 
 
 		 448 aa  593  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3194  hypothetical protein  62.28 
 
 		 451 aa  584  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2775  hypothetical protein  61.2 
 
 		 450 aa  587  1e-166  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1069  decarboxylase family protein  61.38 
 
 		 454 aa  581  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0850  hypothetical protein  61.88 
 
 		 460 aa  575  1.0000000000000001e-163  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0350692  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1809  hypothetical protein  59.1 
 
 		 454 aa  570  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1909  decarboxylase family protein  59.73 
 
 		 457 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0510531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3498  hypothetical protein  59.73 
 
 		 468 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3302  hypothetical protein  59.73 
 
 		 457 aa  566  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10730  hypothetical protein  58.13 
 
 		 461 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0977  hypothetical protein  58.71 
 
 		 461 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3650  hypothetical protein  59.73 
 
 		 460 aa  555  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2241  hypothetical protein  58.48 
 
 		 457 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3662  decarboxylase family protein  57.94 
 
 		 457 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358077  normal  0.251066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2067  hypothetical protein  57.94 
 
 		 457 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.841023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2241  hypothetical protein  57.94 
 
 		 457 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27090  hypothetical protein  57.24 
 
 		 457 aa  543  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.649053  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0422  hypothetical protein  56.82 
 
 		 457 aa  537  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1377  hypothetical protein  55.93 
 
 		 462 aa  532  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.152492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3796  hypothetical protein  58.26 
 
 		 456 aa  527  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.024661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01319  decarboxylase family protein  55.61 
 
 		 461 aa  511  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12391  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1708  hypothetical protein  54.71 
 
 		 464 aa  485  1e-136  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1882  hypothetical protein  52.24 
 
 		 457 aa  483  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000892818  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1770  hypothetical protein  54.48 
 
 		 464 aa  483  1e-135  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2520  hypothetical protein  29.89 
 
 		 260 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177513 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  29.92 
 
 		 225 aa  56.2  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2800  hypothetical protein  28.96 
 
 		 275 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.983756  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2520  hypothetical protein  28.49 
 
 		 236 aa  53.9  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.220081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  27.17 
 
 		 266 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  29.6 
 
 		 313 aa  52.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  27.93 
 
 		 259 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  28.32 
 
 		 217 aa  50.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  27.17 
 
 		 216 aa  50.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1904  decarboxylase family protein  24.18 
 
 		 342 aa  50.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0178748  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0709  hypothetical protein  30.09 
 
 		 259 aa  50.1  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3064  hypothetical protein  25.23 
 
 		 342 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00713435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3710  hypothetical protein  25 
 
 		 351 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  25.73 
 
 		 266 aa  49.7  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1267  hypothetical protein  23.81 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.13698e-16  decreased coverage  0.00000000000243562 
 
 
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  27.04 
 
 		 263 aa  48.5  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0567  hypothetical protein  27.59 
 
 		 242 aa  47.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.892575  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  27.49 
 
 		 275 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  32.06 
 
 		 267 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  32.17 
 
 		 271 aa  47.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  30.89 
 
 		 273 aa  47.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  29.53 
 
 		 235 aa  47.4  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  30.37 
 
 		 220 aa  47.4  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3314  hypothetical protein  28.02 
 
 		 270 aa  47.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  25.81 
 
 		 280 aa  47.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  28.82 
 
 		 264 aa  47  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  33.07 
 
 		 243 aa  47  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  25 
 
 		 190 aa  47  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  28.4 
 
 		 289 aa  47  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  29.17 
 
 		 269 aa  46.6  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  31.06 
 
 		 263 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>