107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3459 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1550  hypothetical protein  78.84 
 
 		 451 aa  758    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2557  hypothetical protein  79.29 
 
 		 451 aa  745    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2715  hypothetical protein  78.17 
 
 		 451 aa  754    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.715742  normal  0.0118371 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2783  hypothetical protein  78.4 
 
 		 451 aa  756    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.241401  normal  0.0251261 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2775  hypothetical protein  76.39 
 
 		 454 aa  726    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2885  hypothetical protein  77.95 
 
 		 451 aa  751    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2419  hypothetical protein  78.17 
 
 		 451 aa  725    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1372  hypothetical protein  76.61 
 
 		 451 aa  748    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2755  hypothetical protein  82.67 
 
 		 450 aa  779    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0317572 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1290  hypothetical protein  76.61 
 
 		 451 aa  741    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.921441  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0421  hypothetical protein  65.93 
 
 		 457 aa  636    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.100113  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1358  hypothetical protein  76.84 
 
 		 451 aa  749    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3310  hypothetical protein  87.56 
 
 		 450 aa  816    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2975  hypothetical protein  80.8 
 
 		 450 aa  753    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.202766  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1397  hypothetical protein  76.61 
 
 		 451 aa  749    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.262603  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3459  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  930    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000318169 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2987  hypothetical protein  76.84 
 
 		 451 aa  749    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000362342 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004247  decarboxylase family protein  67.11 
 
 		 458 aa  638    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01190  hypothetical protein  66.89 
 
 		 458 aa  621  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0695  hypothetical protein  62.58 
 
 		 452 aa  613  9.999999999999999e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.360136  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3801  hypothetical protein  62.39 
 
 		 454 aa  604  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121315  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0931  hypothetical protein  62.39 
 
 		 454 aa  604  9.999999999999999e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3373  hypothetical protein  61.73 
 
 		 454 aa  599  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3174  hypothetical protein  61.5 
 
 		 454 aa  596  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02640  hypothetical protein  61.89 
 
 		 454 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1003  putative decarboxylase  61.95 
 
 		 454 aa  592  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0026607  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2939  hypothetical protein  61.89 
 
 		 454 aa  593  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.275577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3100  hypothetical protein  61.89 
 
 		 454 aa  593  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.484247  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3156  hypothetical protein  61.95 
 
 		 454 aa  592  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1056  hypothetical protein  61.95 
 
 		 454 aa  592  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0917  hypothetical protein  61.89 
 
 		 454 aa  593  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2935  hypothetical protein  61.67 
 
 		 454 aa  592  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.153502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4059  hypothetical protein  61.89 
 
 		 454 aa  593  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2990  hypothetical protein  61.18 
 
 		 457 aa  591  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02602  hypothetical protein  61.89 
 
 		 454 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0893  conserved hypothetical protein  61.67 
 
 		 454 aa  588  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746871  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3537  lysine decarboxylase family protein  62.58 
 
 		 448 aa  589  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3248  hypothetical protein  61.28 
 
 		 454 aa  588  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.322877  normal  0.240176 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3077  hypothetical protein  61.67 
 
 		 454 aa  591  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.465683  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3192  lysine decarboxylase family protein  61.5 
 
 		 454 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3176  lysine decarboxylase family protein  61.5 
 
 		 454 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133947  normal  0.691033 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3129  lysine decarboxylase family protein  61.5 
 
 		 454 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3111  lysine decarboxylase family protein  61.5 
 
 		 454 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113256  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3291  lysine decarboxylase family protein  61.5 
 
 		 454 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3194  hypothetical protein  62.64 
 
 		 451 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03047  hypothetical protein  61.16 
 
 		 454 aa  584  1.0000000000000001e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0303345  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2775  hypothetical protein  60.58 
 
 		 450 aa  572  1.0000000000000001e-162  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1069  decarboxylase family protein  58.17 
 
 		 454 aa  562  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3091  decarboxylase family protein  58.13 
 
 		 454 aa  556  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00268916  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3302  hypothetical protein  58.48 
 
 		 457 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1809  hypothetical protein  58.43 
 
 		 454 aa  553  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1909  decarboxylase family protein  57.37 
 
 		 457 aa  549  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0510531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3498  hypothetical protein  57.33 
 
 		 468 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0850  hypothetical protein  59.87 
 
 		 460 aa  546  1e-154  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0350692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10730  hypothetical protein  56.25 
 
 		 461 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0977  hypothetical protein  56.25 
 
 		 461 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3662  decarboxylase family protein  55.78 
 
 		 457 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358077  normal  0.251066 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3650  hypothetical protein  57.62 
 
 		 460 aa  541  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0422  hypothetical protein  56.7 
 
 		 457 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2067  hypothetical protein  55.78 
 
 		 457 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.841023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2241  hypothetical protein  55.33 
 
 		 457 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2241  hypothetical protein  55.33 
 
 		 457 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27090  hypothetical protein  55.36 
 
 		 457 aa  532  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.649053  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3796  hypothetical protein  57.49 
 
 		 456 aa  527  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.024661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1377  hypothetical protein  55.83 
 
 		 462 aa  523  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.152492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01319  decarboxylase family protein  56.25 
 
 		 461 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12391  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1882  hypothetical protein  52.36 
 
 		 457 aa  477  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000892818  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1708  hypothetical protein  54.24 
 
 		 464 aa  473  1e-132  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1770  hypothetical protein  54.48 
 
 		 464 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  25.15 
 
 		 225 aa  56.2  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  24.18 
 
 		 259 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0709  hypothetical protein  25.14 
 
 		 259 aa  49.7  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3314  hypothetical protein  27.32 
 
 		 270 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  22.73 
 
 		 266 aa  48.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2800  hypothetical protein  26.44 
 
 		 275 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.983756  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  25.65 
 
 		 247 aa  47.8  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  34.82 
 
 		 243 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  30.47 
 
 		 266 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3064  hypothetical protein  26.73 
 
 		 342 aa  47  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00713435  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  29.58 
 
 		 263 aa  47  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  24.71 
 
 		 266 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  31.86 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  28.68 
 
 		 217 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  26.53 
 
 		 263 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  27.85 
 
 		 275 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  34.38 
 
 		 263 aa  45.8  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  25.62 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  23.84 
 
 		 245 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  31.9 
 
 		 274 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2520  hypothetical protein  29.88 
 
 		 236 aa  45.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.220081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  29.63 
 
 		 292 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3379  hypothetical protein  24.46 
 
 		 260 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  30.92 
 
 		 267 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  31.9 
 
 		 268 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  20.34 
 
 		 273 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  31.9 
 
 		 268 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2520  hypothetical protein  25.99 
 
 		 260 aa  44.3  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  23.08 
 
 		 235 aa  44.3  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  27.92 
 
 		 216 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  24.19 
 
 		 241 aa  43.5  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>