181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0695 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02640  hypothetical protein  65.93 
 
 		 454 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0893  conserved hypothetical protein  65.71 
 
 		 454 aa  637    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746871  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3077  hypothetical protein  65.71 
 
 		 454 aa  638    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.465683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4059  hypothetical protein  65.93 
 
 		 454 aa  640    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3129  lysine decarboxylase family protein  66.59 
 
 		 454 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3174  hypothetical protein  68.21 
 
 		 454 aa  662    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3373  hypothetical protein  68.87 
 
 		 454 aa  668    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3156  hypothetical protein  68.43 
 
 		 454 aa  670    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004247  decarboxylase family protein  77.78 
 
 		 458 aa  736    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2990  hypothetical protein  67.11 
 
 		 457 aa  650    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2783  hypothetical protein  64.67 
 
 		 451 aa  635    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.241401  normal  0.0251261 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3176  lysine decarboxylase family protein  66.59 
 
 		 454 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133947  normal  0.691033 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2775  hypothetical protein  65.56 
 
 		 450 aa  640    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0931  hypothetical protein  68.87 
 
 		 454 aa  669    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3291  lysine decarboxylase family protein  66.59 
 
 		 454 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02602  hypothetical protein  65.93 
 
 		 454 aa  640    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1056  hypothetical protein  68.43 
 
 		 454 aa  670    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2935  hypothetical protein  65.93 
 
 		 454 aa  640    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.153502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0917  hypothetical protein  65.93 
 
 		 454 aa  640    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3111  lysine decarboxylase family protein  66.59 
 
 		 454 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113256  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3192  lysine decarboxylase family protein  66.59 
 
 		 454 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3801  hypothetical protein  67.55 
 
 		 454 aa  658    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121315  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3248  hypothetical protein  66.59 
 
 		 454 aa  646    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.322877  normal  0.240176 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1290  hypothetical protein  64.89 
 
 		 451 aa  636    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.921441  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0421  hypothetical protein  78.1 
 
 		 457 aa  751    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.100113  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1003  putative decarboxylase  68.43 
 
 		 454 aa  670    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0026607  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0695  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  937    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.360136  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01190  hypothetical protein  78.49 
 
 		 458 aa  723    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2939  hypothetical protein  65.93 
 
 		 454 aa  640    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.275577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3100  hypothetical protein  65.93 
 
 		 454 aa  640    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.484247  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1397  hypothetical protein  64.44 
 
 		 451 aa  631  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.262603  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2715  hypothetical protein  64.67 
 
 		 451 aa  633  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.715742  normal  0.0118371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2987  hypothetical protein  64.67 
 
 		 451 aa  631  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000362342 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1358  hypothetical protein  64.67 
 
 		 451 aa  631  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2885  hypothetical protein  64.44 
 
 		 451 aa  628  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1372  hypothetical protein  64.44 
 
 		 451 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1550  hypothetical protein  64.22 
 
 		 451 aa  625  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2557  hypothetical protein  63.33 
 
 		 451 aa  608  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2419  hypothetical protein  64.89 
 
 		 451 aa  610  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2975  hypothetical protein  64 
 
 		 450 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.202766  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2775  hypothetical protein  62 
 
 		 454 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3459  hypothetical protein  62.58 
 
 		 450 aa  595  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000318169 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2755  hypothetical protein  64.14 
 
 		 450 aa  596  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0317572 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3310  hypothetical protein  62.58 
 
 		 450 aa  592  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029835 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0850  hypothetical protein  62.36 
 
 		 460 aa  583  1.0000000000000001e-165  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0350692  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3091  decarboxylase family protein  57.33 
 
 		 454 aa  564  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00268916  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03047  hypothetical protein  57.49 
 
 		 454 aa  562  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0303345  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3537  lysine decarboxylase family protein  58.22 
 
 		 448 aa  557  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3498  hypothetical protein  56.03 
 
 		 468 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1909  decarboxylase family protein  56.15 
 
 		 457 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0510531  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1809  hypothetical protein  56.6 
 
 		 454 aa  551  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3194  hypothetical protein  59.06 
 
 		 451 aa  554  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10730  hypothetical protein  55.93 
 
 		 461 aa  549  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0422  hypothetical protein  57.49 
 
 		 457 aa  548  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0977  hypothetical protein  56.15 
 
 		 461 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1069  decarboxylase family protein  54.93 
 
 		 454 aa  546  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3662  decarboxylase family protein  55.36 
 
 		 457 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358077  normal  0.251066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2241  hypothetical protein  55.13 
 
 		 457 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2067  hypothetical protein  55.36 
 
 		 457 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.841023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3302  hypothetical protein  54.81 
 
 		 457 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2241  hypothetical protein  54.91 
 
 		 457 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27090  hypothetical protein  55.03 
 
 		 457 aa  540  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.649053  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3650  hypothetical protein  56.15 
 
 		 460 aa  540  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1377  hypothetical protein  53.35 
 
 		 462 aa  516  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.152492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1882  hypothetical protein  52.9 
 
 		 457 aa  512  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000892818  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01319  decarboxylase family protein  54.59 
 
 		 461 aa  502  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12391  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3796  hypothetical protein  53.79 
 
 		 456 aa  503  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.024661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1708  hypothetical protein  53.91 
 
 		 464 aa  496  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1770  hypothetical protein  53.91 
 
 		 464 aa  495  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  33.99 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3064  hypothetical protein  26.91 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00713435  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  30 
 
 		 241 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2520  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.220081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  30 
 
 		 217 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  29.13 
 
 		 225 aa  54.7  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3710  hypothetical protein  26.32 
 
 		 351 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  31.06 
 
 		 271 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  31.93 
 
 		 264 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  31.25 
 
 		 266 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  30.71 
 
 		 249 aa  52.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  27.07 
 
 		 313 aa  52.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  29.63 
 
 		 289 aa  51.6  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2800  hypothetical protein  29.55 
 
 		 275 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.983756  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1904  decarboxylase family protein  28.19 
 
 		 342 aa  50.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0178748  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  32.8 
 
 		 243 aa  50.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0555  hypothetical protein  28.29 
 
 		 241 aa  50.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456463  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0709  hypothetical protein  33.01 
 
 		 259 aa  50.1  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  28.38 
 
 		 275 aa  50.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  31.03 
 
 		 186 aa  50.1  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  27.78 
 
 		 273 aa  50.1  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3649  hypothetical protein  28.1 
 
 		 359 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  26.59 
 
 		 259 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  26.9 
 
 		 266 aa  49.7  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  24.34 
 
 		 247 aa  48.5  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  32.28 
 
 		 315 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  25.32 
 
 		 261 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  28.38 
 
 		 243 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2714  hypothetical protein  26.27 
 
 		 190 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.489323  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  32.28 
 
 		 292 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  32.28 
 
 		 292 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>