152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3650 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3650  hypothetical protein  100 
 
 
460 aa  949    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3302  hypothetical protein  61.37 
 
 
457 aa  598  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1809  hypothetical protein  62.22 
 
 
454 aa  598  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10730  hypothetical protein  61.18 
 
 
461 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3091  decarboxylase family protein  61.67 
 
 
454 aa  592  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00268916  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0977  hypothetical protein  60.31 
 
 
461 aa  591  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1909  decarboxylase family protein  60.62 
 
 
457 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0510531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3498  hypothetical protein  60.4 
 
 
468 aa  589  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0422  hypothetical protein  61.5 
 
 
457 aa  590  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27090  hypothetical protein  60.49 
 
 
457 aa  584  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.649053  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2241  hypothetical protein  60.66 
 
 
457 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3662  decarboxylase family protein  60.44 
 
 
457 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358077  normal  0.251066 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004247  decarboxylase family protein  60.54 
 
 
458 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2067  hypothetical protein  60.44 
 
 
457 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.841023  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1069  decarboxylase family protein  60.49 
 
 
454 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2241  hypothetical protein  60 
 
 
457 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0421  hypothetical protein  58.42 
 
 
457 aa  570  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.100113  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3796  hypothetical protein  60.96 
 
 
456 aa  566  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.024661  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2715  hypothetical protein  59.73 
 
 
451 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.715742  normal  0.0118371 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2783  hypothetical protein  59.73 
 
 
451 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.241401  normal  0.0251261 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1290  hypothetical protein  58.71 
 
 
451 aa  555  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.921441  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1550  hypothetical protein  59.51 
 
 
451 aa  554  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2775  hypothetical protein  55.88 
 
 
450 aa  551  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01190  hypothetical protein  59.64 
 
 
458 aa  553  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2885  hypothetical protein  59.51 
 
 
451 aa  550  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2987  hypothetical protein  57.94 
 
 
451 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000362342 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1372  hypothetical protein  57.72 
 
 
451 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1358  hypothetical protein  57.94 
 
 
451 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1397  hypothetical protein  57.72 
 
 
451 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.262603  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1003  putative decarboxylase  57.43 
 
 
454 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0026607  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3801  hypothetical protein  56.98 
 
 
454 aa  543  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121315  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3156  hypothetical protein  57.43 
 
 
454 aa  543  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1056  hypothetical protein  57.43 
 
 
454 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3373  hypothetical protein  56.54 
 
 
454 aa  539  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0931  hypothetical protein  56.76 
 
 
454 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3174  hypothetical protein  56.32 
 
 
454 aa  538  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0695  hypothetical protein  56.15 
 
 
452 aa  540  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.360136  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2990  hypothetical protein  56.17 
 
 
457 aa  535  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02640  hypothetical protein  56.32 
 
 
454 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0893  conserved hypothetical protein  56.32 
 
 
454 aa  532  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746871  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02602  hypothetical protein  56.32 
 
 
454 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2557  hypothetical protein  57.72 
 
 
451 aa  531  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2775  hypothetical protein  57.72 
 
 
454 aa  533  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2939  hypothetical protein  56.32 
 
 
454 aa  531  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.275577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3100  hypothetical protein  56.32 
 
 
454 aa  531  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.484247  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0917  hypothetical protein  56.32 
 
 
454 aa  531  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4059  hypothetical protein  56.32 
 
 
454 aa  531  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267999  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1377  hypothetical protein  56.54 
 
 
462 aa  531  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.152492  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2935  hypothetical protein  56.32 
 
 
454 aa  531  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.153502  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3077  hypothetical protein  56.1 
 
 
454 aa  530  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.465683  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3291  lysine decarboxylase family protein  55.88 
 
 
454 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3176  lysine decarboxylase family protein  55.88 
 
 
454 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133947  normal  0.691033 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3129  lysine decarboxylase family protein  55.88 
 
 
454 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3248  hypothetical protein  56.1 
 
 
454 aa  528  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.322877  normal  0.240176 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3111  lysine decarboxylase family protein  55.88 
 
 
454 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113256  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3192  lysine decarboxylase family protein  55.88 
 
 
454 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01319  decarboxylase family protein  57.49 
 
 
461 aa  524  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12391  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3537  lysine decarboxylase family protein  54.07 
 
 
448 aa  520  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03047  hypothetical protein  55.9 
 
 
454 aa  521  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0303345  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2975  hypothetical protein  57.37 
 
 
450 aa  519  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.202766  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3459  hypothetical protein  57.62 
 
 
450 aa  521  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000318169 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2419  hypothetical protein  57.37 
 
 
451 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2755  hypothetical protein  56.25 
 
 
450 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0317572 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3310  hypothetical protein  56.73 
 
 
450 aa  509  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0029835 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0850  hypothetical protein  54.04 
 
 
460 aa  501  1e-140  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0350692  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3194  hypothetical protein  55.48 
 
 
451 aa  497  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1770  hypothetical protein  55.95 
 
 
464 aa  496  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1708  hypothetical protein  55.95 
 
 
464 aa  496  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1882  hypothetical protein  50.98 
 
 
457 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000892818  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  30.06 
 
 
217 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  29.73 
 
 
243 aa  57  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  25.26 
 
 
273 aa  57  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3064  hypothetical protein  25.37 
 
 
342 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00713435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  29.61 
 
 
259 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2800  hypothetical protein  32.21 
 
 
275 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.983756  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  27.75 
 
 
245 aa  54.7  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  27.22 
 
 
263 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  25.93 
 
 
255 aa  53.9  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  27.38 
 
 
275 aa  53.5  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  28.85 
 
 
261 aa  53.5  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3314  hypothetical protein  28.09 
 
 
270 aa  53.5  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3710  hypothetical protein  24.71 
 
 
351 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  28.35 
 
 
225 aa  52.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  27.44 
 
 
266 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  27.46 
 
 
313 aa  51.6  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1267  hypothetical protein  23.14 
 
 
342 aa  50.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.13698e-16  decreased coverage  0.00000000000243562 
 
 
 
NC_011886  Achl_2520  hypothetical protein  26.82 
 
 
260 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177513 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  27.59 
 
 
269 aa  50.1  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  28.74 
 
 
267 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  27.41 
 
 
280 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11220  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  29.38 
 
 
266 aa  49.7  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124999  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  25.14 
 
 
247 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  29.29 
 
 
249 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  28.48 
 
 
262 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6766  hypothetical protein  24.09 
 
 
360 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  30.52 
 
 
268 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  28.39 
 
 
289 aa  48.5  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1201  hypothetical protein  26.23 
 
 
243 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  25.43 
 
 
216 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  31.72 
 
 
267 aa  48.1  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>