187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3192 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02640  hypothetical protein  94.27 
 
 
454 aa  884    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0893  conserved hypothetical protein  94.05 
 
 
454 aa  880    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746871  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3176  lysine decarboxylase family protein  100 
 
 
454 aa  935    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133947  normal  0.691033 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3291  lysine decarboxylase family protein  99.78 
 
 
454 aa  934    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0931  hypothetical protein  86.56 
 
 
454 aa  819    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004247  decarboxylase family protein  68.06 
 
 
458 aa  655    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3111  lysine decarboxylase family protein  100 
 
 
454 aa  935    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113256  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3077  hypothetical protein  94.05 
 
 
454 aa  882    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.465683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2935  hypothetical protein  94.05 
 
 
454 aa  883    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.153502  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3174  hypothetical protein  84.8 
 
 
454 aa  810    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4059  hypothetical protein  94.27 
 
 
454 aa  884    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267999  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02602  hypothetical protein  94.27 
 
 
454 aa  884    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2990  hypothetical protein  84.03 
 
 
457 aa  796    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1056  hypothetical protein  84.36 
 
 
454 aa  800    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0917  hypothetical protein  94.27 
 
 
454 aa  884    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0695  hypothetical protein  66.59 
 
 
452 aa  650    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.360136  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3373  hypothetical protein  86.78 
 
 
454 aa  818    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3192  lysine decarboxylase family protein  100 
 
 
454 aa  935    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3129  lysine decarboxylase family protein  100 
 
 
454 aa  935    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3248  hypothetical protein  95.37 
 
 
454 aa  897    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.322877  normal  0.240176 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0421  hypothetical protein  69.67 
 
 
457 aa  670    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.100113  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3156  hypothetical protein  84.36 
 
 
454 aa  800    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1003  putative decarboxylase  84.36 
 
 
454 aa  800    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0026607  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01190  hypothetical protein  67.4 
 
 
458 aa  639    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2939  hypothetical protein  94.27 
 
 
454 aa  884    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.275577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3100  hypothetical protein  94.27 
 
 
454 aa  884    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.484247  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3801  hypothetical protein  87.44 
 
 
454 aa  827    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121315  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2715  hypothetical protein  66 
 
 
451 aa  628  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.715742  normal  0.0118371 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2783  hypothetical protein  66 
 
 
451 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.241401  normal  0.0251261 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2885  hypothetical protein  65.78 
 
 
451 aa  622  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1550  hypothetical protein  64.68 
 
 
451 aa  616  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2987  hypothetical protein  64.68 
 
 
451 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000362342 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1358  hypothetical protein  64.68 
 
 
451 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1372  hypothetical protein  64.6 
 
 
451 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1290  hypothetical protein  64.46 
 
 
451 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.921441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1397  hypothetical protein  64.46 
 
 
451 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.262603  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2775  hypothetical protein  62.83 
 
 
450 aa  610  1e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2775  hypothetical protein  62.39 
 
 
454 aa  600  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2557  hypothetical protein  63.27 
 
 
451 aa  592  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2419  hypothetical protein  65.27 
 
 
451 aa  592  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2755  hypothetical protein  63.22 
 
 
450 aa  591  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0317572 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2975  hypothetical protein  63.94 
 
 
450 aa  593  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.202766  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0850  hypothetical protein  62.61 
 
 
460 aa  575  1.0000000000000001e-163  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0350692  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3459  hypothetical protein  61.5 
 
 
450 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000318169 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3310  hypothetical protein  61.28 
 
 
450 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0029835 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3537  lysine decarboxylase family protein  59.29 
 
 
448 aa  562  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1809  hypothetical protein  58.67 
 
 
454 aa  556  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27090  hypothetical protein  57.43 
 
 
457 aa  551  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.649053  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3302  hypothetical protein  57.43 
 
 
457 aa  551  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10730  hypothetical protein  57.02 
 
 
461 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0977  hypothetical protein  57.02 
 
 
461 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1909  decarboxylase family protein  56.98 
 
 
457 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0510531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3498  hypothetical protein  56.76 
 
 
468 aa  548  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03047  hypothetical protein  57.43 
 
 
454 aa  546  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0303345  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3091  decarboxylase family protein  57.49 
 
 
454 aa  543  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00268916  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1069  decarboxylase family protein  57.11 
 
 
454 aa  543  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2241  hypothetical protein  56.1 
 
 
457 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3662  decarboxylase family protein  55.65 
 
 
457 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358077  normal  0.251066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0422  hypothetical protein  56.57 
 
 
457 aa  534  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2067  hypothetical protein  55.65 
 
 
457 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.841023  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2241  hypothetical protein  55.43 
 
 
457 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3194  hypothetical protein  57.24 
 
 
451 aa  526  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3650  hypothetical protein  55.88 
 
 
460 aa  527  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3796  hypothetical protein  54.02 
 
 
456 aa  501  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.024661  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1377  hypothetical protein  54.67 
 
 
462 aa  494  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.152492  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01319  decarboxylase family protein  54.57 
 
 
461 aa  479  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12391  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1882  hypothetical protein  50.89 
 
 
457 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000892818  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1770  hypothetical protein  53.57 
 
 
464 aa  460  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1708  hypothetical protein  53.11 
 
 
464 aa  457  1e-127  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  28 
 
 
313 aa  60.8  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  26.42 
 
 
245 aa  56.2  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  27.57 
 
 
266 aa  55.5  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  24.73 
 
 
245 aa  55.1  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3649  hypothetical protein  27.23 
 
 
359 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  28.12 
 
 
247 aa  54.7  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  35.4 
 
 
271 aa  54.3  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  28.49 
 
 
263 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  29.73 
 
 
220 aa  53.1  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0239  lysine decarboxylase family protein  27.66 
 
 
211 aa  53.1  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  27.55 
 
 
275 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  26.11 
 
 
225 aa  52.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  27.67 
 
 
273 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  29.63 
 
 
332 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  24.86 
 
 
245 aa  52.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0709  hypothetical protein  28.1 
 
 
259 aa  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  27.59 
 
 
259 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  28.02 
 
 
279 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  33.8 
 
 
243 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19460  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  30.82 
 
 
288 aa  51.2  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0125018 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  24.86 
 
 
245 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  28.8 
 
 
258 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  26.6 
 
 
217 aa  51.2  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  26.8 
 
 
260 aa  50.8  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2520  hypothetical protein  31.2 
 
 
236 aa  50.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.220081  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  27.91 
 
 
280 aa  50.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  26.24 
 
 
216 aa  50.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  31.54 
 
 
263 aa  50.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  27.71 
 
 
245 aa  50.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  27.53 
 
 
263 aa  50.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  27.71 
 
 
239 aa  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  0.0000460605 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>