120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0850 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0850  hypothetical protein  100 
 
 		 460 aa  950    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0350692  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0421  hypothetical protein  64.59 
 
 		 457 aa  605  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.100113  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004247  decarboxylase family protein  63.47 
 
 		 458 aa  598  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01190  hypothetical protein  64.18 
 
 		 458 aa  589  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0695  hypothetical protein  62.36 
 
 		 452 aa  583  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.360136  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3373  hypothetical protein  62.83 
 
 		 454 aa  580  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3174  hypothetical protein  62.83 
 
 		 454 aa  580  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0931  hypothetical protein  62.83 
 
 		 454 aa  580  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2715  hypothetical protein  61.88 
 
 		 451 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.715742  normal  0.0118371 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2783  hypothetical protein  61.88 
 
 		 451 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.241401  normal  0.0251261 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2885  hypothetical protein  62.11 
 
 		 451 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3248  hypothetical protein  61.95 
 
 		 454 aa  575  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.322877  normal  0.240176 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1290  hypothetical protein  62.11 
 
 		 451 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.921441  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3192  lysine decarboxylase family protein  62.61 
 
 		 454 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3176  lysine decarboxylase family protein  62.61 
 
 		 454 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133947  normal  0.691033 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3129  lysine decarboxylase family protein  62.61 
 
 		 454 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3111  lysine decarboxylase family protein  62.61 
 
 		 454 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113256  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1550  hypothetical protein  61.66 
 
 		 451 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1003  putative decarboxylase  62.39 
 
 		 454 aa  571  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0026607  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3801  hypothetical protein  61.95 
 
 		 454 aa  572  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121315  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3156  hypothetical protein  62.39 
 
 		 454 aa  571  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1056  hypothetical protein  62.39 
 
 		 454 aa  571  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3291  lysine decarboxylase family protein  62.61 
 
 		 454 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02640  hypothetical protein  61.95 
 
 		 454 aa  568  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1358  hypothetical protein  61.43 
 
 		 451 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2939  hypothetical protein  61.95 
 
 		 454 aa  568  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.275577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3100  hypothetical protein  61.95 
 
 		 454 aa  568  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.484247  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1397  hypothetical protein  61.21 
 
 		 451 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.262603  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0917  hypothetical protein  61.95 
 
 		 454 aa  568  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3077  hypothetical protein  62.17 
 
 		 454 aa  570  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.465683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4059  hypothetical protein  61.95 
 
 		 454 aa  568  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2987  hypothetical protein  61.43 
 
 		 451 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000362342 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2990  hypothetical protein  61.79 
 
 		 457 aa  570  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02602  hypothetical protein  61.95 
 
 		 454 aa  568  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0893  conserved hypothetical protein  61.73 
 
 		 454 aa  565  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746871  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1372  hypothetical protein  61.21 
 
 		 451 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2935  hypothetical protein  61.73 
 
 		 454 aa  567  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.153502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2775  hypothetical protein  60.31 
 
 		 454 aa  560  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2419  hypothetical protein  60.99 
 
 		 451 aa  543  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2557  hypothetical protein  58.74 
 
 		 451 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2775  hypothetical protein  58.57 
 
 		 450 aa  541  9.999999999999999e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3310  hypothetical protein  60.54 
 
 		 450 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2975  hypothetical protein  60.54 
 
 		 450 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.202766  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2755  hypothetical protein  59.19 
 
 		 450 aa  534  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0317572 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03047  hypothetical protein  56.17 
 
 		 454 aa  533  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0303345  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3459  hypothetical protein  59.87 
 
 		 450 aa  530  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000318169 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3194  hypothetical protein  57.96 
 
 		 451 aa  523  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3537  lysine decarboxylase family protein  56.05 
 
 		 448 aa  515  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3091  decarboxylase family protein  54.26 
 
 		 454 aa  511  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00268916  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1909  decarboxylase family protein  53.57 
 
 		 457 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0510531  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3302  hypothetical protein  53.69 
 
 		 457 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0977  hypothetical protein  52.23 
 
 		 461 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2241  hypothetical protein  52.9 
 
 		 457 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3662  decarboxylase family protein  52.46 
 
 		 457 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358077  normal  0.251066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3498  hypothetical protein  53.12 
 
 		 468 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10730  hypothetical protein  52.01 
 
 		 461 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2067  hypothetical protein  52.46 
 
 		 457 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.841023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2241  hypothetical protein  52.23 
 
 		 457 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1069  decarboxylase family protein  54.48 
 
 		 454 aa  499  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3650  hypothetical protein  54.04 
 
 		 460 aa  501  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0422  hypothetical protein  52.68 
 
 		 457 aa  495  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27090  hypothetical protein  52.24 
 
 		 457 aa  497  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.649053  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1809  hypothetical protein  52.69 
 
 		 454 aa  491  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1377  hypothetical protein  50.67 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.152492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3796  hypothetical protein  52.23 
 
 		 456 aa  463  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.024661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01319  decarboxylase family protein  51.35 
 
 		 461 aa  457  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12391  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1770  hypothetical protein  51.12 
 
 		 464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1708  hypothetical protein  50.89 
 
 		 464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1882  hypothetical protein  47.76 
 
 		 457 aa  436  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000892818  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0239  lysine decarboxylase family protein  30.88 
 
 		 211 aa  57  0.0000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  27.49 
 
 		 266 aa  52  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  26.01 
 
 		 313 aa  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  27.53 
 
 		 220 aa  51.6  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  27.93 
 
 		 263 aa  51.6  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  28.47 
 
 		 263 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3064  hypothetical protein  26.98 
 
 		 342 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00713435  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  26.35 
 
 		 225 aa  49.7  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0049  lysine decarboxylase family protein  24.84 
 
 		 201 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.435452  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  26.85 
 
 		 273 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  31.01 
 
 		 249 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2520  hypothetical protein  31.01 
 
 		 236 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.220081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  24.12 
 
 		 260 aa  48.5  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0709  hypothetical protein  30.1 
 
 		 259 aa  47.8  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0091  lysine decarboxylase family protein  24.84 
 
 		 201 aa  47.8  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3710  hypothetical protein  27.57 
 
 		 351 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  30.08 
 
 		 266 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  22.63 
 
 		 261 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1441  hypothetical protein  26.22 
 
 		 197 aa  47  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00785449  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1267  hypothetical protein  24.87 
 
 		 342 aa  46.6  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.13698e-16  decreased coverage  0.00000000000243562 
 
 
 
NC_002939  GSU1904  decarboxylase family protein  28.39 
 
 		 342 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0178748  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0899  hypothetical protein  26.79 
 
 		 340 aa  46.6  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.114072  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  24.89 
 
 		 283 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  26.01 
 
 		 216 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  31.25 
 
 		 247 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  30.58 
 
 		 271 aa  45.8  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  26.86 
 
 		 235 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  27.06 
 
 		 217 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0063  lysine decarboxylase family protein  27.56 
 
 		 202 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  29.81 
 
 		 342 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  27.21 
 
 		 245 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>