More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2520 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2520  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  485  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.220081  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0464  hypothetical protein  43.72 
 
 
235 aa  149  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0428  hypothetical protein  46.2 
 
 
213 aa  148  8e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2015  hypothetical protein  42.86 
 
 
205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0476  hypothetical protein  51.03 
 
 
218 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  39.18 
 
 
239 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  40.66 
 
 
249 aa  131  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  37.5 
 
 
239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  44.07 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  39.39 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  38.53 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  44.72 
 
 
241 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  39.06 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2231  hypothetical protein  37.02 
 
 
317 aa  129  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1602  hypothetical protein  44.17 
 
 
218 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  36.54 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0170  hypothetical protein  39.67 
 
 
218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177593 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  36.06 
 
 
317 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2032  hypothetical protein  41.99 
 
 
222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1780  hypothetical protein  40.33 
 
 
218 aa  125  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00264225  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11220  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  40.33 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124999  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  44.1 
 
 
273 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  41.72 
 
 
245 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  41.72 
 
 
239 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  0.0000460605 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  40.1 
 
 
266 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  44.9 
 
 
252 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  44.9 
 
 
252 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0164  hypothetical protein  44.74 
 
 
242 aa  122  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0567  hypothetical protein  39.57 
 
 
242 aa  122  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.892575  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  44.08 
 
 
244 aa  122  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  44.9 
 
 
252 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  44.9 
 
 
252 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  44.9 
 
 
252 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  37.36 
 
 
261 aa  121  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  37.77 
 
 
266 aa  121  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  42.86 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  38 
 
 
241 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  42.86 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  44.22 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  44.22 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  42.76 
 
 
249 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2452  hypothetical protein  38.42 
 
 
242 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  42.76 
 
 
249 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0555  hypothetical protein  41.86 
 
 
241 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456463  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  42.76 
 
 
249 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  42.76 
 
 
244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  42.86 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  42.76 
 
 
244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  42.76 
 
 
244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  42.76 
 
 
244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  42.76 
 
 
244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  44 
 
 
243 aa  118  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  36.65 
 
 
242 aa  118  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  37.17 
 
 
229 aa  118  9e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  46.9 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  39.01 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  40.49 
 
 
216 aa  116  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  38.3 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  35.91 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1000  hypothetical protein  40.49 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  42.86 
 
 
269 aa  112  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  40.49 
 
 
267 aa  113  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4133  hypothetical protein  38.83 
 
 
283 aa  113  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242281  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  36.32 
 
 
264 aa  113  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3814  hypothetical protein  37.62 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.383956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  44.83 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  38.07 
 
 
235 aa  111  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  35.26 
 
 
260 aa  111  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4232  hypothetical protein  41.14 
 
 
365 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000692535 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  44.14 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3898  hypothetical protein  35.68 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  35.96 
 
 
279 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  42.67 
 
 
280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  35.9 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  38.19 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  34.92 
 
 
262 aa  108  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  40 
 
 
266 aa  108  7.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  41.67 
 
 
247 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0049  lysine decarboxylase family protein  40.79 
 
 
201 aa  107  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.435452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  36.98 
 
 
267 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  35.14 
 
 
220 aa  107  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0091  lysine decarboxylase family protein  40.79 
 
 
201 aa  107  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  38.04 
 
 
266 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  36.81 
 
 
259 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3064  hypothetical protein  35.98 
 
 
342 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00713435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  42.67 
 
 
248 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3045  hypothetical protein  39.26 
 
 
342 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00166986  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  34.74 
 
 
255 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  36.61 
 
 
289 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  37.77 
 
 
332 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19460  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  41.38 
 
 
288 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0125018 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0447  hypothetical protein  38.06 
 
 
355 aa  106  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.101585  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2422  hypothetical protein  43.48 
 
 
241 aa  105  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113296  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2520  hypothetical protein  36.93 
 
 
260 aa  105  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177513 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2800  hypothetical protein  35.14 
 
 
275 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.983756  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1504  hypothetical protein  39.86 
 
 
352 aa  105  6e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023514 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  34.34 
 
 
247 aa  105  8e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0709  hypothetical protein  33.48 
 
 
259 aa  105  8e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  32.97 
 
 
313 aa  105  8e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  42.76 
 
 
275 aa  104  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>