187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3537 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3537  lysine decarboxylase family protein  100 
 
 		 448 aa  928    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2987  hypothetical protein  62.08 
 
 		 451 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000362342 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2775  hypothetical protein  62.75 
 
 		 454 aa  597  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1358  hypothetical protein  62.08 
 
 		 451 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2715  hypothetical protein  61.86 
 
 		 451 aa  593  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.715742  normal  0.0118371 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2783  hypothetical protein  61.86 
 
 		 451 aa  594  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.241401  normal  0.0251261 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2885  hypothetical protein  62.53 
 
 		 451 aa  593  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1372  hypothetical protein  61.86 
 
 		 451 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1290  hypothetical protein  61.42 
 
 		 451 aa  591  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.921441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1397  hypothetical protein  61.64 
 
 		 451 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.262603  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1550  hypothetical protein  61.86 
 
 		 451 aa  590  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2557  hypothetical protein  63.19 
 
 		 451 aa  590  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3194  hypothetical protein  64.88 
 
 		 451 aa  587  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03047  hypothetical protein  61.52 
 
 		 454 aa  586  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0303345  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3174  hypothetical protein  61.06 
 
 		 454 aa  580  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2775  hypothetical protein  59.33 
 
 		 450 aa  576  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3310  hypothetical protein  62.81 
 
 		 450 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029835 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02640  hypothetical protein  60.18 
 
 		 454 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0917  hypothetical protein  60.18 
 
 		 454 aa  569  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3459  hypothetical protein  62.58 
 
 		 450 aa  570  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000318169 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0931  hypothetical protein  61.28 
 
 		 454 aa  570  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4059  hypothetical protein  60.18 
 
 		 454 aa  569  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2935  hypothetical protein  59.96 
 
 		 454 aa  568  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.153502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2990  hypothetical protein  60.22 
 
 		 457 aa  571  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02602  hypothetical protein  60.18 
 
 		 454 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3373  hypothetical protein  61.28 
 
 		 454 aa  569  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004247  decarboxylase family protein  60.67 
 
 		 458 aa  568  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.124703  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2939  hypothetical protein  60.18 
 
 		 454 aa  569  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.275577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3100  hypothetical protein  60.18 
 
 		 454 aa  569  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.484247  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0893  conserved hypothetical protein  59.96 
 
 		 454 aa  565  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746871  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1056  hypothetical protein  59.96 
 
 		 454 aa  567  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0421  hypothetical protein  60.62 
 
 		 457 aa  566  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.100113  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3077  hypothetical protein  59.96 
 
 		 454 aa  567  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.465683  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1003  putative decarboxylase  59.96 
 
 		 454 aa  567  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0026607  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3801  hypothetical protein  59.38 
 
 		 454 aa  567  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121315  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2975  hypothetical protein  61.86 
 
 		 450 aa  567  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.202766  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3156  hypothetical protein  59.96 
 
 		 454 aa  567  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3192  lysine decarboxylase family protein  59.29 
 
 		 454 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2755  hypothetical protein  61.02 
 
 		 450 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0317572 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3248  hypothetical protein  59.96 
 
 		 454 aa  564  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.322877  normal  0.240176 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01190  hypothetical protein  61.42 
 
 		 458 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3291  lysine decarboxylase family protein  59.29 
 
 		 454 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3176  lysine decarboxylase family protein  59.29 
 
 		 454 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133947  normal  0.691033 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3129  lysine decarboxylase family protein  59.29 
 
 		 454 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3111  lysine decarboxylase family protein  59.29 
 
 		 454 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113256  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0695  hypothetical protein  58.22 
 
 		 452 aa  557  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.360136  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2419  hypothetical protein  60.31 
 
 		 451 aa  553  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3091  decarboxylase family protein  56.67 
 
 		 454 aa  545  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00268916  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1809  hypothetical protein  56.57 
 
 		 454 aa  546  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1909  decarboxylase family protein  57.11 
 
 		 457 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0510531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3498  hypothetical protein  56.67 
 
 		 468 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27090  hypothetical protein  56.67 
 
 		 457 aa  538  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.649053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10730  hypothetical protein  56.1 
 
 		 461 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0977  hypothetical protein  56.54 
 
 		 461 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3302  hypothetical protein  55.78 
 
 		 457 aa  531  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2241  hypothetical protein  55.78 
 
 		 457 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3662  decarboxylase family protein  55.01 
 
 		 457 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358077  normal  0.251066 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1069  decarboxylase family protein  55.13 
 
 		 454 aa  525  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0422  hypothetical protein  55.88 
 
 		 457 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2067  hypothetical protein  55.01 
 
 		 457 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.841023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3650  hypothetical protein  54.07 
 
 		 460 aa  520  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2241  hypothetical protein  54.57 
 
 		 457 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0850  hypothetical protein  56.05 
 
 		 460 aa  515  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0350692  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3796  hypothetical protein  56.4 
 
 		 456 aa  513  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.024661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1377  hypothetical protein  56.03 
 
 		 462 aa  503  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.152492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01319  decarboxylase family protein  56.28 
 
 		 461 aa  495  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12391  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1882  hypothetical protein  50.9 
 
 		 457 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000892818  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1708  hypothetical protein  53.91 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1770  hypothetical protein  53.79 
 
 		 464 aa  461  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  37.1 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  26.85 
 
 		 225 aa  54.7  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0709  hypothetical protein  31.45 
 
 		 259 aa  54.3  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  31.69 
 
 		 263 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  26.32 
 
 		 252 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  30.23 
 
 		 229 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  29.41 
 
 		 263 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1441  hypothetical protein  26.23 
 
 		 197 aa  52.8  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00785449  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2452  hypothetical protein  25.13 
 
 		 242 aa  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  26.84 
 
 		 247 aa  52.4  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  28.05 
 
 		 266 aa  52.4  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  28.57 
 
 		 247 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  27 
 
 		 252 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  27 
 
 		 252 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  29.38 
 
 		 245 aa  51.2  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  30 
 
 		 289 aa  51.6  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  25.88 
 
 		 252 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  25.88 
 
 		 252 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  25.88 
 
 		 252 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  27.27 
 
 		 261 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  25.27 
 
 		 266 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  28.57 
 
 		 247 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  28.57 
 
 		 218 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  30.77 
 
 		 241 aa  50.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  33.07 
 
 		 243 aa  50.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  28.17 
 
 		 249 aa  50.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  28.17 
 
 		 249 aa  50.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0555  hypothetical protein  30.07 
 
 		 241 aa  50.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456463  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2015  hypothetical protein  32.43 
 
 		 205 aa  50.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  27.01 
 
 		 259 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  27.53 
 
 		 255 aa  50.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>