More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1022 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  100 
 
 
315 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  99.66 
 
 
319 aa  593  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  99.66 
 
 
319 aa  593  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  99.66 
 
 
319 aa  593  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  100 
 
 
292 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  99.66 
 
 
292 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  93.13 
 
 
318 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  66.67 
 
 
342 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  64.8 
 
 
342 aa  358  9e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  67.43 
 
 
275 aa  358  9e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  51.14 
 
 
299 aa  257  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  44.4 
 
 
291 aa  255  7e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  50.57 
 
 
297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  50 
 
 
288 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  49.43 
 
 
288 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  49.49 
 
 
305 aa  250  3e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  42.54 
 
 
294 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  45.99 
 
 
304 aa  247  2e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  42.91 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  49.28 
 
 
287 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  40.81 
 
 
288 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  45.67 
 
 
292 aa  241  9e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  42.16 
 
 
282 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  49.04 
 
 
287 aa  239  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  49.04 
 
 
287 aa  239  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  42.86 
 
 
279 aa  238  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  43.2 
 
 
276 aa  237  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  43.2 
 
 
279 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  50.19 
 
 
299 aa  236  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  46.27 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  46.97 
 
 
273 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  48.46 
 
 
292 aa  233  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  50.59 
 
 
297 aa  233  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  47.53 
 
 
303 aa  232  6e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  47.84 
 
 
296 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  47.17 
 
 
289 aa  229  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  45.91 
 
 
288 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  46.9 
 
 
268 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  46.9 
 
 
268 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  48.64 
 
 
284 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  47.89 
 
 
301 aa  226  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  46.67 
 
 
287 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  48.84 
 
 
288 aa  225  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  47.84 
 
 
287 aa  225  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  43.3 
 
 
274 aa  225  9e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  45.49 
 
 
302 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  47.37 
 
 
261 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  42.97 
 
 
270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  48.08 
 
 
301 aa  222  6e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  48.66 
 
 
291 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  43.41 
 
 
272 aa  218  1e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  44.48 
 
 
276 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  48.28 
 
 
299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  47.88 
 
 
283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  44.57 
 
 
285 aa  210  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  45.85 
 
 
284 aa  209  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  54.34 
 
 
175 aa  198  9e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  44.4 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  45.63 
 
 
282 aa  195  8.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  47.13 
 
 
279 aa  192  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  42.57 
 
 
271 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  64.62 
 
 
147 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  41.06 
 
 
251 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  45.3 
 
 
273 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  47.67 
 
 
225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  43.98 
 
 
261 aa  153  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  44.89 
 
 
247 aa  149  6e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  44.77 
 
 
235 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  42.02 
 
 
220 aa  145  9e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  47.25 
 
 
267 aa  144  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  32.86 
 
 
266 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  44.13 
 
 
245 aa  142  5e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  56.25 
 
 
263 aa  142  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  44.32 
 
 
275 aa  142  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  43.9 
 
 
229 aa  141  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  41.4 
 
 
247 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11220  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  45.76 
 
 
266 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124999  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  40.86 
 
 
247 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  46.11 
 
 
241 aa  140  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  40.94 
 
 
244 aa  139  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0299  hypothetical protein  45.83 
 
 
244 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000150026  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  40.86 
 
 
218 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  40.32 
 
 
252 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  46.3 
 
 
263 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  40.32 
 
 
249 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  43.33 
 
 
269 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  40.32 
 
 
252 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  40.32 
 
 
249 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  39.11 
 
 
280 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  40.85 
 
 
242 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  40.32 
 
 
252 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  40.32 
 
 
252 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  40.32 
 
 
252 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  40.32 
 
 
252 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  40.32 
 
 
252 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  43.96 
 
 
243 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  51.49 
 
 
266 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  40.32 
 
 
249 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  40.32 
 
 
244 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  40.32 
 
 
244 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>