71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3252 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3060  CRISPR-associated Cse4 family protein  86.93 
 
 		 351 aa  634    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3252  crispr-associated protein, Cse4 family  100 
 
 		 352 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633483  normal  0.732205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3135  Cse4 family CRISPR-associated protein  92.33 
 
 		 352 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3069  crispr-associated protein, Cse4 family  93.47 
 
 		 352 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4011  CRISPR-associated protein, Cse4 family  87.22 
 
 		 351 aa  633  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.453377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2886  CRISPR-associated Cse4 family protein  86.08 
 
 		 351 aa  610  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3151  CRISPR-associated protein Cse4 family  57.1 
 
 		 352 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.784001 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3095  crispr-associated protein, Cse4 family  56.53 
 
 		 352 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0478447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0400  CRISPR-associated protein, Cse4 family  56.34 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0182914  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2477  CRISPR-associated protein, Cse4 family  54.49 
 
 		 356 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3588  CRISPR-associated protein, Cse4 family  54.67 
 
 		 345 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3545  CRISPR-associated Cse4 family protein  54.83 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  0.0809396 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0959  CRISPR-associated Cse4 family protein  51.08 
 
 		 373 aa  363  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0596  CRISPR-associated Cse4 family protein  50.27 
 
 		 367 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000866758  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2986  CRISPR-associated Cse4 family protein  48.1 
 
 		 370 aa  347  1e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1378  CRISPR-associated Cse4 family protein  47.78 
 
 		 382 aa  343  2e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0035432  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0229  CRISPR-associated Cse4 family protein  54.41 
 
 		 368 aa  341  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5412  CRISPR-associated protein, Cse4 family  51.41 
 
 		 346 aa  332  8e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.995476  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0862  CRISPR-associated Cse4 family protein  48.54 
 
 		 376 aa  331  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1605  CRISPR-associated protein, Cse4 family  47.85 
 
 		 368 aa  325  6e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.936152 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0425  CRISPR-associated protein, Cse4 family  51.16 
 
 		 352 aa  323  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00278102  normal  0.032174 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00868  CRISPR-associated protein, Cse4 family  51.71 
 
 		 315 aa  321  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1811  CRISPR-associated Cse4 family protein  43.82 
 
 		 370 aa  291  8e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3317  CRISPR-associated Cse4 family protein  43.82 
 
 		 370 aa  291  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0172  CRISPR-associated Cse4 family protein  50.3 
 
 		 359 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406672  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17200  CRISPR-associated protein, CT1975  36.68 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3052  CRISPR-associated protein, Cse4 family  36.36 
 
 		 378 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000809112  hitchhiker  0.00221304 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0781  CRISPR-associated protein, Cse4 family  37.46 
 
 		 413 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1898  CRISPR-associated protein, Cse4 family  35.65 
 
 		 382 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1233  CRISPR-associated protein, Cse4 family  36.9 
 
 		 388 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00111756  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3016  Cse4 family CRISPR-associated protein  34.59 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000977881  normal  0.046365 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0648  CRISPR-associated Cse4 family protein  35.07 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626197 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2827  CRISPR-associated Cse4 family protein  33.78 
 
 		 384 aa  170  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2340  CRISPR-associated Cse4 family protein  37.42 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1590  CRISPR-associated Cse4 family protein  37.06 
 
 		 373 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0781  CRISPR-associated protein, Cse4 family  36.44 
 
 		 413 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3758  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.46 
 
 		 384 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.398681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2682  CRISPR-associated protein, Cse4 family  35.22 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000309604  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2231  CRISPR-associated protein, Cse4 family  36.67 
 
 		 394 aa  162  8.000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1598  CRISPR-associated Cse4 family protein  36.45 
 
 		 397 aa  160  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00285454  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1589  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.73 
 
 		 337 aa  159  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.466428  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0020  CRISPR-associated Cse4 family protein  36.71 
 
 		 384 aa  159  9e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.451411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1283  CRISPR-associated protein, Cse4 family  37.15 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0952  CRISPR-associated Cse4 family protein  32.86 
 
 		 385 aa  156  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.195706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1533  Cse4 family CRISPR-associated protein  33.44 
 
 		 392 aa  155  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0986  CRISPR-associated protein, Cse4 family  34.31 
 
 		 386 aa  152  7e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17160  CRISPR-associated protein, Cse4 family  35.31 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0483  CRISPR-associated protein, Cse4 family  32.38 
 
 		 423 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.797503  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3907  CRISPR-associated protein, Cse4 family  34.45 
 
 		 399 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000018703  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0762  CRISPR system CASCADE complex protein CasC  31.82 
 
 		 362 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0450827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17330  CRISPR-associated protein, Cse4 family  34.29 
 
 		 381 aa  146  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0344  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.47 
 
 		 381 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1974  CRISPR-associated Cse4 family protein  35.42 
 
 		 380 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.466584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2575  CRISPR-associated Cse4 family protein  35.02 
 
 		 387 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107855 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3217  CRISPR-associated protein  31.81 
 
 		 373 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.879676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2632  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.25 
 
 		 385 aa  139  8.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0926  CRISPR-associated protein, Cse4 family  32.2 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1415  CRISPR-associated protein, Cse4 family  30.19 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0668384 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0933  CRISPR-associated Cse4 family protein  30 
 
 		 414 aa  133  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0723191  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2674  CRISPR-associated protein, Cse4 family  31.91 
 
 		 347 aa  133  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0908  CRISPR-associated protein, Cse4 family  32.57 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.580096  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2162  CRISPR-associated protein, Cse4 family  30.97 
 
 		 378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4091  CRISPR-associated protein, Cse4 family  40.46 
 
 		 501 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0943  CRISPR-associated protein, Cse4 family  33.24 
 
 		 399 aa  123  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.669234  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13890  CRISPR-associated protein, Cse4 family  33.23 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325909  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0830  CRISPR-associated Cse4 family protein  28.61 
 
 		 408 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.50766  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1387  CRISPR-associated Cse4 family protein  30.57 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0954  CRISPR-associated Cse4 family protein  31.33 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2897  CRISPR-associated Cse4 family protein  30.57 
 
 		 363 aa  106  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.317201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0930  CRISPR-associated protein, Cse4 family  31.33 
 
 		 363 aa  105  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2441  CRISPR-associated protein, Cse4 family  30.1 
 
 		 480 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>