71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17160 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_17160  CRISPR-associated protein, Cse4 family  100 
 
 
390 aa  791    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1590  CRISPR-associated Cse4 family protein  52.08 
 
 
373 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1974  CRISPR-associated Cse4 family protein  46.19 
 
 
380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.466584  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0943  CRISPR-associated protein, Cse4 family  41.27 
 
 
399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.669234  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1898  CRISPR-associated protein, Cse4 family  38.29 
 
 
382 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13890  CRISPR-associated protein, Cse4 family  37.95 
 
 
368 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325909  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3052  CRISPR-associated protein, Cse4 family  39.65 
 
 
378 aa  216  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000809112  hitchhiker  0.00221304 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0762  CRISPR system CASCADE complex protein CasC  34.2 
 
 
362 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0450827 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0986  CRISPR-associated protein, Cse4 family  39.04 
 
 
386 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2682  CRISPR-associated protein, Cse4 family  38.55 
 
 
397 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000309604  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1598  CRISPR-associated Cse4 family protein  37.46 
 
 
397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00285454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3907  CRISPR-associated protein, Cse4 family  37.93 
 
 
399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000018703  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0020  CRISPR-associated Cse4 family protein  38.02 
 
 
384 aa  197  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.451411  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1533  Cse4 family CRISPR-associated protein  39.72 
 
 
392 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1283  CRISPR-associated protein, Cse4 family  37.96 
 
 
395 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2340  CRISPR-associated Cse4 family protein  38.33 
 
 
374 aa  192  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17330  CRISPR-associated protein, Cse4 family  36.78 
 
 
381 aa  192  9e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2575  CRISPR-associated Cse4 family protein  38.59 
 
 
387 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0107855 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2827  CRISPR-associated Cse4 family protein  39.16 
 
 
384 aa  187  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1233  CRISPR-associated protein, Cse4 family  36.09 
 
 
388 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00111756  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17200  CRISPR-associated protein, CT1975  38.46 
 
 
380 aa  179  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0830  CRISPR-associated Cse4 family protein  35.04 
 
 
408 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.50766  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3758  CRISPR-associated Cse4 family protein  36.84 
 
 
384 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.398681 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3016  Cse4 family CRISPR-associated protein  35.47 
 
 
390 aa  177  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000977881  normal  0.046365 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3252  crispr-associated protein, Cse4 family  36.25 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633483  normal  0.732205 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3060  CRISPR-associated Cse4 family protein  36.08 
 
 
351 aa  164  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4011  CRISPR-associated protein, Cse4 family  36.08 
 
 
351 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.453377  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3069  crispr-associated protein, Cse4 family  35.94 
 
 
352 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0400  CRISPR-associated protein, Cse4 family  34.91 
 
 
355 aa  161  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0182914  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0425  CRISPR-associated protein, Cse4 family  34.88 
 
 
352 aa  159  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00278102  normal  0.032174 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0926  CRISPR-associated protein, Cse4 family  33.53 
 
 
350 aa  159  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0648  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.33 
 
 
402 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.626197 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3135  Cse4 family CRISPR-associated protein  34.38 
 
 
352 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2477  CRISPR-associated protein, Cse4 family  33.23 
 
 
356 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3545  CRISPR-associated Cse4 family protein  32.85 
 
 
344 aa  153  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  0.0809396 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1811  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.66 
 
 
370 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3095  crispr-associated protein, Cse4 family  35.83 
 
 
352 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0478447  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2886  CRISPR-associated Cse4 family protein  35.76 
 
 
351 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420598  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0959  CRISPR-associated Cse4 family protein  33.13 
 
 
373 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3317  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.66 
 
 
370 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3151  CRISPR-associated protein Cse4 family  35.19 
 
 
352 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.784001 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2632  CRISPR-associated Cse4 family protein  36.26 
 
 
385 aa  150  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1378  CRISPR-associated Cse4 family protein  32.28 
 
 
382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0035432  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1605  CRISPR-associated protein, Cse4 family  32.77 
 
 
368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.936152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5412  CRISPR-associated protein, Cse4 family  35.42 
 
 
346 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.995476  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3588  CRISPR-associated protein, Cse4 family  35.74 
 
 
345 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4091  CRISPR-associated protein, Cse4 family  33.44 
 
 
501 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347558  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1589  CRISPR-associated Cse4 family protein  32.12 
 
 
337 aa  146  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.466428  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0172  CRISPR-associated Cse4 family protein  36.14 
 
 
359 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406672  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2674  CRISPR-associated protein, Cse4 family  31.65 
 
 
347 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2986  CRISPR-associated Cse4 family protein  33.74 
 
 
370 aa  144  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0229  CRISPR-associated Cse4 family protein  33.61 
 
 
368 aa  143  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1387  CRISPR-associated Cse4 family protein  33.92 
 
 
364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2897  CRISPR-associated Cse4 family protein  33.14 
 
 
363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.317201  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0954  CRISPR-associated Cse4 family protein  32.86 
 
 
363 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0908  CRISPR-associated protein, Cse4 family  30.46 
 
 
344 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.580096  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0930  CRISPR-associated protein, Cse4 family  32.86 
 
 
363 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2231  CRISPR-associated protein, Cse4 family  34.09 
 
 
394 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1415  CRISPR-associated protein, Cse4 family  31.21 
 
 
347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0668384 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2162  CRISPR-associated protein, Cse4 family  28.75 
 
 
378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0862  CRISPR-associated Cse4 family protein  33.23 
 
 
376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0596  CRISPR-associated Cse4 family protein  32.28 
 
 
367 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000866758  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0344  CRISPR-associated Cse4 family protein  29.14 
 
 
381 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00868  CRISPR-associated protein, Cse4 family  31.33 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0781  CRISPR-associated protein, Cse4 family  31.58 
 
 
413 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0952  CRISPR-associated Cse4 family protein  27.93 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.195706  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0781  CRISPR-associated protein, Cse4 family  32.65 
 
 
413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3217  CRISPR-associated protein  29.04 
 
 
373 aa  109  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.879676  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2441  CRISPR-associated protein, Cse4 family  31.84 
 
 
480 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0483  CRISPR-associated protein, Cse4 family  29.17 
 
 
423 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.797503  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0933  CRISPR-associated Cse4 family protein  26.93 
 
 
414 aa  90.5  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0723191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>