71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17330 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_17330  CRISPR-associated protein, Cse4 family  100 
 
 		 381 aa  784    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0020  CRISPR-associated Cse4 family protein  53.83 
 
 		 384 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.451411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0762  CRISPR system CASCADE complex protein CasC  42.69 
 
 		 362 aa  270  4e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0450827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2575  CRISPR-associated Cse4 family protein  44.72 
 
 		 387 aa  265  8e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107855 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3052  CRISPR-associated protein, Cse4 family  45.75 
 
 		 378 aa  263  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000809112  hitchhiker  0.00221304 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1598  CRISPR-associated Cse4 family protein  44.9 
 
 		 397 aa  252  7e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00285454  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0986  CRISPR-associated protein, Cse4 family  44.64 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3907  CRISPR-associated protein, Cse4 family  41.85 
 
 		 399 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000018703  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1283  CRISPR-associated protein, Cse4 family  46.48 
 
 		 395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2682  CRISPR-associated protein, Cse4 family  42.77 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000309604  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1898  CRISPR-associated protein, Cse4 family  42.9 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1533  Cse4 family CRISPR-associated protein  42.7 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3016  Cse4 family CRISPR-associated protein  41.52 
 
 		 390 aa  220  3.9999999999999997e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000977881  normal  0.046365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17200  CRISPR-associated protein, CT1975  42.07 
 
 		 380 aa  220  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3758  CRISPR-associated Cse4 family protein  42.33 
 
 		 384 aa  219  6e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.398681 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1233  CRISPR-associated protein, Cse4 family  40.29 
 
 		 388 aa  217  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00111756  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2340  CRISPR-associated Cse4 family protein  39.15 
 
 		 374 aa  206  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1974  CRISPR-associated Cse4 family protein  36.32 
 
 		 380 aa  199  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.466584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2827  CRISPR-associated Cse4 family protein  37.07 
 
 		 384 aa  189  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1590  CRISPR-associated Cse4 family protein  36.39 
 
 		 373 aa  182  7e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2632  CRISPR-associated Cse4 family protein  40.63 
 
 		 385 aa  177  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17160  CRISPR-associated protein, Cse4 family  36.44 
 
 		 390 aa  176  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0926  CRISPR-associated protein, Cse4 family  33.94 
 
 		 350 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0830  CRISPR-associated Cse4 family protein  32.98 
 
 		 408 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.50766  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0648  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.21 
 
 		 402 aa  159  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626197 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0959  CRISPR-associated Cse4 family protein  35.58 
 
 		 373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2477  CRISPR-associated protein, Cse4 family  35.85 
 
 		 356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2674  CRISPR-associated protein, Cse4 family  35.69 
 
 		 347 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3095  crispr-associated protein, Cse4 family  36.62 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0478447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5412  CRISPR-associated protein, Cse4 family  36.01 
 
 		 346 aa  149  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.995476  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4091  CRISPR-associated protein, Cse4 family  38.46 
 
 		 501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3151  CRISPR-associated protein Cse4 family  35.67 
 
 		 352 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.784001 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3252  crispr-associated protein, Cse4 family  34.29 
 
 		 352 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633483  normal  0.732205 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1387  CRISPR-associated Cse4 family protein  35.33 
 
 		 364 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0425  CRISPR-associated protein, Cse4 family  33.86 
 
 		 352 aa  145  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00278102  normal  0.032174 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3588  CRISPR-associated protein, Cse4 family  37.13 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1605  CRISPR-associated protein, Cse4 family  33.44 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.936152 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1378  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.22 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0035432  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2897  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.38 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.317201  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3060  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.64 
 
 		 351 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0908  CRISPR-associated protein, Cse4 family  35.43 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.580096  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4011  CRISPR-associated protein, Cse4 family  34.31 
 
 		 351 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.453377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1811  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.59 
 
 		 370 aa  144  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0172  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.51 
 
 		 359 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406672  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0930  CRISPR-associated protein, Cse4 family  34.38 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0229  CRISPR-associated Cse4 family protein  32.82 
 
 		 368 aa  143  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13890  CRISPR-associated protein, Cse4 family  33.7 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325909  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3135  Cse4 family CRISPR-associated protein  34.2 
 
 		 352 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2986  CRISPR-associated Cse4 family protein  33.43 
 
 		 370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2886  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.31 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3545  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.84 
 
 		 344 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  0.0809396 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3317  CRISPR-associated Cse4 family protein  33.62 
 
 		 370 aa  140  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0954  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.07 
 
 		 363 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3069  crispr-associated protein, Cse4 family  33.88 
 
 		 352 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0596  CRISPR-associated Cse4 family protein  31.55 
 
 		 367 aa  138  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000866758  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0943  CRISPR-associated protein, Cse4 family  34.15 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.669234  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1589  CRISPR-associated Cse4 family protein  30.84 
 
 		 337 aa  133  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.466428  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2162  CRISPR-associated protein, Cse4 family  31.03 
 
 		 378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1415  CRISPR-associated protein, Cse4 family  30.56 
 
 		 347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0668384 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0400  CRISPR-associated protein, Cse4 family  32.66 
 
 		 355 aa  123  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0182914  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0862  CRISPR-associated Cse4 family protein  30.12 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2441  CRISPR-associated protein, Cse4 family  41.72 
 
 		 480 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2231  CRISPR-associated protein, Cse4 family  30.29 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00868  CRISPR-associated protein, Cse4 family  34.43 
 
 		 315 aa  109  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0344  CRISPR-associated Cse4 family protein  30.61 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0483  CRISPR-associated protein, Cse4 family  28.12 
 
 		 423 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.797503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0781  CRISPR-associated protein, Cse4 family  29.44 
 
 		 413 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0781  CRISPR-associated protein, Cse4 family  29.5 
 
 		 413 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0952  CRISPR-associated Cse4 family protein  26.99 
 
 		 385 aa  89  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.195706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3217  CRISPR-associated protein  28.94 
 
 		 373 aa  86.7  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.879676  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0933  CRISPR-associated Cse4 family protein  26.55 
 
 		 414 aa  76.3  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0723191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>