71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3758 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3758  CRISPR-associated Cse4 family protein  100 
 
 		 384 aa  779    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.398681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17200  CRISPR-associated protein, CT1975  84.11 
 
 		 380 aa  624  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1233  CRISPR-associated protein, Cse4 family  54.24 
 
 		 388 aa  371  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00111756  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3016  Cse4 family CRISPR-associated protein  52.44 
 
 		 390 aa  359  5e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000977881  normal  0.046365 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1898  CRISPR-associated protein, Cse4 family  52.79 
 
 		 382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2827  CRISPR-associated Cse4 family protein  46.15 
 
 		 384 aa  288  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2632  CRISPR-associated Cse4 family protein  53.03 
 
 		 385 aa  287  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2340  CRISPR-associated Cse4 family protein  46.15 
 
 		 374 aa  282  7.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0020  CRISPR-associated Cse4 family protein  43.87 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.451411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1598  CRISPR-associated Cse4 family protein  41.6 
 
 		 397 aa  243  6e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00285454  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3052  CRISPR-associated protein, Cse4 family  46.46 
 
 		 378 aa  242  9e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000809112  hitchhiker  0.00221304 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2682  CRISPR-associated protein, Cse4 family  41.44 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000309604  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1283  CRISPR-associated protein, Cse4 family  44.71 
 
 		 395 aa  233  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1533  Cse4 family CRISPR-associated protein  44.31 
 
 		 392 aa  233  6e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3907  CRISPR-associated protein, Cse4 family  41.69 
 
 		 399 aa  225  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000018703  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0762  CRISPR system CASCADE complex protein CasC  38.56 
 
 		 362 aa  224  3e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0450827 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0986  CRISPR-associated protein, Cse4 family  40.78 
 
 		 386 aa  222  8e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17330  CRISPR-associated protein, Cse4 family  42.33 
 
 		 381 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2575  CRISPR-associated Cse4 family protein  39.62 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107855 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0648  CRISPR-associated Cse4 family protein  35.13 
 
 		 402 aa  189  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626197 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2674  CRISPR-associated protein, Cse4 family  38.41 
 
 		 347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3545  CRISPR-associated Cse4 family protein  37.38 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  0.0809396 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2986  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.71 
 
 		 370 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2477  CRISPR-associated protein, Cse4 family  34.06 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1974  CRISPR-associated Cse4 family protein  33.9 
 
 		 380 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.466584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3317  CRISPR-associated Cse4 family protein  38.51 
 
 		 370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1811  CRISPR-associated Cse4 family protein  38.82 
 
 		 370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0830  CRISPR-associated Cse4 family protein  33.6 
 
 		 408 aa  173  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.50766  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1378  CRISPR-associated Cse4 family protein  35.33 
 
 		 382 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0035432  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0908  CRISPR-associated protein, Cse4 family  37.19 
 
 		 344 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.580096  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0926  CRISPR-associated protein, Cse4 family  32.23 
 
 		 350 aa  171  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3095  crispr-associated protein, Cse4 family  33.78 
 
 		 352 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0478447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0959  CRISPR-associated Cse4 family protein  36.07 
 
 		 373 aa  170  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1590  CRISPR-associated Cse4 family protein  33.33 
 
 		 373 aa  170  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3060  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.44 
 
 		 351 aa  169  9e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3151  CRISPR-associated protein Cse4 family  32.97 
 
 		 352 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.784001 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4011  CRISPR-associated protein, Cse4 family  35.59 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.453377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1605  CRISPR-associated protein, Cse4 family  32.98 
 
 		 368 aa  166  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.936152 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17160  CRISPR-associated protein, Cse4 family  36.92 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0425  CRISPR-associated protein, Cse4 family  37.25 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00278102  normal  0.032174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3252  crispr-associated protein, Cse4 family  33.99 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633483  normal  0.732205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5412  CRISPR-associated protein, Cse4 family  38.87 
 
 		 346 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.995476  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1415  CRISPR-associated protein, Cse4 family  33.63 
 
 		 347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0668384 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3135  Cse4 family CRISPR-associated protein  33.99 
 
 		 352 aa  163  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2886  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.41 
 
 		 351 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0229  CRISPR-associated Cse4 family protein  36.2 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1589  CRISPR-associated Cse4 family protein  33.16 
 
 		 337 aa  160  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.466428  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4091  CRISPR-associated protein, Cse4 family  43.6 
 
 		 501 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3588  CRISPR-associated protein, Cse4 family  36.9 
 
 		 345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0172  CRISPR-associated Cse4 family protein  36.53 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406672  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2162  CRISPR-associated protein, Cse4 family  34.08 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3069  crispr-associated protein, Cse4 family  33.33 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1387  CRISPR-associated Cse4 family protein  33.99 
 
 		 364 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0596  CRISPR-associated Cse4 family protein  35.17 
 
 		 367 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000866758  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0400  CRISPR-associated protein, Cse4 family  32.95 
 
 		 355 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0182914  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0862  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.06 
 
 		 376 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0930  CRISPR-associated protein, Cse4 family  32.38 
 
 		 363 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13890  CRISPR-associated protein, Cse4 family  34.17 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325909  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2897  CRISPR-associated Cse4 family protein  32.12 
 
 		 363 aa  143  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.317201  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0954  CRISPR-associated Cse4 family protein  32.12 
 
 		 363 aa  142  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0943  CRISPR-associated protein, Cse4 family  33.05 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.669234  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0344  CRISPR-associated Cse4 family protein  32.48 
 
 		 381 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00868  CRISPR-associated protein, Cse4 family  34.06 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0483  CRISPR-associated protein, Cse4 family  30.02 
 
 		 423 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.797503  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3217  CRISPR-associated protein  32.45 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.879676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2231  CRISPR-associated protein, Cse4 family  29.24 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2441  CRISPR-associated protein, Cse4 family  38.37 
 
 		 480 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0952  CRISPR-associated Cse4 family protein  29.19 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.195706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0781  CRISPR-associated protein, Cse4 family  31.11 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0933  CRISPR-associated Cse4 family protein  30.73 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0723191  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0781  CRISPR-associated protein, Cse4 family  51.02 
 
 		 413 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>