71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0781 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0781  CRISPR-associated protein, Cse4 family  86.44 
 
 
413 aa  706    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0781  CRISPR-associated protein, Cse4 family  100 
 
 
413 aa  836    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0483  CRISPR-associated protein, Cse4 family  52.82 
 
 
423 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.797503  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2231  CRISPR-associated protein, Cse4 family  46.52 
 
 
394 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0933  CRISPR-associated Cse4 family protein  46.77 
 
 
414 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0723191  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0952  CRISPR-associated Cse4 family protein  42.65 
 
 
385 aa  286  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.195706  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0344  CRISPR-associated Cse4 family protein  43.34 
 
 
381 aa  263  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3217  CRISPR-associated protein  41.32 
 
 
373 aa  244  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.879676  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0596  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.1 
 
 
367 aa  187  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000866758  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3151  CRISPR-associated protein Cse4 family  35.37 
 
 
352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.784001 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3588  CRISPR-associated protein, Cse4 family  36.04 
 
 
345 aa  182  7e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1378  CRISPR-associated Cse4 family protein  33 
 
 
382 aa  182  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0035432  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3095  crispr-associated protein, Cse4 family  36.32 
 
 
352 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0478447  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3135  Cse4 family CRISPR-associated protein  36.12 
 
 
352 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0400  CRISPR-associated protein, Cse4 family  36.16 
 
 
355 aa  179  8e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0182914  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3069  crispr-associated protein, Cse4 family  34.85 
 
 
352 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3545  CRISPR-associated Cse4 family protein  33.33 
 
 
344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  0.0809396 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0959  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.39 
 
 
373 aa  173  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3252  crispr-associated protein, Cse4 family  37.46 
 
 
352 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633483  normal  0.732205 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2477  CRISPR-associated protein, Cse4 family  34.56 
 
 
356 aa  172  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0862  CRISPR-associated Cse4 family protein  31.82 
 
 
376 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1605  CRISPR-associated protein, Cse4 family  32.94 
 
 
368 aa  169  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.936152 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0425  CRISPR-associated protein, Cse4 family  35.85 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00278102  normal  0.032174 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4011  CRISPR-associated protein, Cse4 family  37.32 
 
 
351 aa  166  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.453377  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3060  CRISPR-associated Cse4 family protein  37.57 
 
 
351 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2986  CRISPR-associated Cse4 family protein  32.63 
 
 
370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0229  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.38 
 
 
368 aa  163  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1811  CRISPR-associated Cse4 family protein  33.67 
 
 
370 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2886  CRISPR-associated Cse4 family protein  36.34 
 
 
351 aa  156  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420598  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3317  CRISPR-associated Cse4 family protein  33.67 
 
 
370 aa  155  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0172  CRISPR-associated Cse4 family protein  33.69 
 
 
359 aa  150  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406672  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5412  CRISPR-associated protein, Cse4 family  36.31 
 
 
346 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.995476  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1589  CRISPR-associated Cse4 family protein  31.54 
 
 
337 aa  144  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.466428  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00868  CRISPR-associated protein, Cse4 family  32.19 
 
 
315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1898  CRISPR-associated protein, Cse4 family  30.7 
 
 
382 aa  133  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0954  CRISPR-associated Cse4 family protein  31.31 
 
 
363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2897  CRISPR-associated Cse4 family protein  31.31 
 
 
363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.317201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0930  CRISPR-associated protein, Cse4 family  31.04 
 
 
363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3016  Cse4 family CRISPR-associated protein  31.27 
 
 
390 aa  126  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000977881  normal  0.046365 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1233  CRISPR-associated protein, Cse4 family  30.94 
 
 
388 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00111756  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1387  CRISPR-associated Cse4 family protein  30.52 
 
 
364 aa  123  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3052  CRISPR-associated protein, Cse4 family  30.41 
 
 
378 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000809112  hitchhiker  0.00221304 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1283  CRISPR-associated protein, Cse4 family  31.66 
 
 
395 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1533  Cse4 family CRISPR-associated protein  30.23 
 
 
392 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1590  CRISPR-associated Cse4 family protein  31.25 
 
 
373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0648  CRISPR-associated Cse4 family protein  27.34 
 
 
402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.626197 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1598  CRISPR-associated Cse4 family protein  29.92 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00285454  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2682  CRISPR-associated protein, Cse4 family  29.44 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000309604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3907  CRISPR-associated protein, Cse4 family  29.2 
 
 
399 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000018703  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17160  CRISPR-associated protein, Cse4 family  30.09 
 
 
390 aa  110  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0943  CRISPR-associated protein, Cse4 family  31.4 
 
 
399 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.669234  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1974  CRISPR-associated Cse4 family protein  28.46 
 
 
380 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.466584  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2340  CRISPR-associated Cse4 family protein  28.24 
 
 
374 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2827  CRISPR-associated Cse4 family protein  29.19 
 
 
384 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0926  CRISPR-associated protein, Cse4 family  28.38 
 
 
350 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0020  CRISPR-associated Cse4 family protein  28.27 
 
 
384 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.451411  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2575  CRISPR-associated Cse4 family protein  29.81 
 
 
387 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0107855 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13890  CRISPR-associated protein, Cse4 family  30.35 
 
 
368 aa  94.7  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325909  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1415  CRISPR-associated protein, Cse4 family  25.39 
 
 
347 aa  94.4  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0668384 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17330  CRISPR-associated protein, Cse4 family  29.44 
 
 
381 aa  94  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2162  CRISPR-associated protein, Cse4 family  29.23 
 
 
378 aa  90.5  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0762  CRISPR system CASCADE complex protein CasC  24.71 
 
 
362 aa  90.1  7e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0450827 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17200  CRISPR-associated protein, CT1975  37.04 
 
 
380 aa  87.4  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2674  CRISPR-associated protein, Cse4 family  28.31 
 
 
347 aa  87.8  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2632  CRISPR-associated Cse4 family protein  30.7 
 
 
385 aa  83.2  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4091  CRISPR-associated protein, Cse4 family  33.88 
 
 
501 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347558  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3758  CRISPR-associated Cse4 family protein  31.11 
 
 
384 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.398681 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0830  CRISPR-associated Cse4 family protein  25.77 
 
 
408 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.50766  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2441  CRISPR-associated protein, Cse4 family  29.47 
 
 
480 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0986  CRISPR-associated protein, Cse4 family  26.67 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0908  CRISPR-associated protein, Cse4 family  30.43 
 
 
344 aa  62.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.580096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>