More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1357 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1357  metal dependent phophohydrolase  100 
 
 
341 aa  703    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0518878  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0886  metal dependent phosphohydrolase  31.29 
 
 
323 aa  159  6e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.286498  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  29.49 
 
 
345 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  40.82 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3676  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.67 
 
 
328 aa  112  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  35.5 
 
 
1333 aa  110  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2833  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 
379 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0209293  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  29.58 
 
 
364 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4319  Metal dependent phosphohydrolase with a response regulator receiver protein  37.18 
 
 
382 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  30.26 
 
 
398 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6715  metal dependent phosphohydrolase  36.6 
 
 
358 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2545  metal dependent phosphohydrolase  37.41 
 
 
269 aa  106  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0663  putative PAS/PAC sensor protein  31.45 
 
 
384 aa  106  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2795  metal dependent phosphohydrolase  34.42 
 
 
357 aa  106  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.835639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2124  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 
346 aa  106  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3894  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.26 
 
 
353 aa  106  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109719  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  34.57 
 
 
574 aa  105  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  33.71 
 
 
481 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
545 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 
402 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2902  response regulator receiver  33.71 
 
 
350 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.1984  normal  0.246098 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  28.21 
 
 
412 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2085  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.12 
 
 
345 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.012958 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  35.36 
 
 
1237 aa  104  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0150  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 
369 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0081  two component transcriptional regulator, AraC family  29.47 
 
 
399 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0206  metal-dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 
369 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44114  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0746  metal dependent phosphohydrolase  33.13 
 
 
384 aa  103  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.545101  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  34.04 
 
 
401 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1050  metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 
1313 aa  103  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7465  metal dependent phosphohydrolase  35.95 
 
 
360 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.049304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1183  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.18 
 
 
363 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  28.27 
 
 
390 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.3 
 
 
351 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  33.53 
 
 
414 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  37.97 
 
 
431 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2876  metal dependent phosphohydrolase  37.74 
 
 
354 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.327621 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0187  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.1 
 
 
354 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0061  metal dependent phosphohydrolase  34.43 
 
 
465 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1018  metal dependent phosphohydrolase  32.7 
 
 
652 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  27.93 
 
 
401 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3169  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.23 
 
 
353 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821118  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 
508 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  31.72 
 
 
403 aa  100  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3269  response regulator  29.81 
 
 
600 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.633194  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  32.35 
 
 
461 aa  100  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1382  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  35.16 
 
 
868 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0126588  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3546  hypothetical protein  34.75 
 
 
350 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00070  Two-component system response regulator RpfG  34.72 
 
 
353 aa  99.8  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0844737  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4396  metal dependent phosphohydrolase  40.15 
 
 
388 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00343832  normal  0.803975 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  28.14 
 
 
372 aa  99.8  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  34.97 
 
 
471 aa  99.4  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2951  response regulator receiver protein  34.18 
 
 
340 aa  99.4  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.129077 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0101  metal dependent phosphohydrolase  33.67 
 
 
360 aa  99  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3076  metal dependent phosphohydrolase  24.27 
 
 
338 aa  99.4  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  28.69 
 
 
320 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  31.86 
 
 
461 aa  99  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1406  response regulator  31.84 
 
 
351 aa  99  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1911  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  30.37 
 
 
268 aa  98.6  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0445959  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4196  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.81 
 
 
350 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  30.41 
 
 
395 aa  99  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  32.56 
 
 
499 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1175  metal dependent phosphohydrolase  33.71 
 
 
389 aa  97.8  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  32.91 
 
 
400 aa  98.2  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  32.69 
 
 
326 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3878  metal dependent phosphohydrolase  29.76 
 
 
362 aa  98.2  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.121402  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  32.78 
 
 
369 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  28.96 
 
 
388 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1894  HD-GYP domain-containing protein  31.82 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  32.31 
 
 
1335 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  30.9 
 
 
518 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.18 
 
 
513 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2670  metal dependent phosphohydrolase, HD region  28.31 
 
 
344 aa  97.8  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0111  metal dependent phosphohydrolase  33.54 
 
 
228 aa  97.8  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.153504  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2294  metal dependent phosphohydrolase  29.85 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4164  response regulator/phosphatase  36.02 
 
 
352 aa  97.1  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  36 
 
 
360 aa  97.1  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5138  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
306 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174977  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  31.15 
 
 
247 aa  97.1  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  33.12 
 
 
539 aa  97.1  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2505  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.48 
 
 
331 aa  97.1  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0639  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.08 
 
 
345 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  30.99 
 
 
438 aa  97.1  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1828  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.75 
 
 
379 aa  97.1  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3198  metal dependent phosphohydrolase  31.2 
 
 
359 aa  97.1  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0348  sensory box protein  34.87 
 
 
212 aa  96.7  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5359  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.75 
 
 
347 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3111  response regulator receiver protein  30.81 
 
 
328 aa  96.3  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0752  metal dependent phosphohydrolase  34.57 
 
 
306 aa  95.9  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0100091  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2655  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  34.87 
 
 
353 aa  96.3  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0663  response regulator receiver  32.1 
 
 
340 aa  95.9  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25160  response regulator  31.48 
 
 
356 aa  95.9  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3942  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
351 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  30.77 
 
 
649 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  31.61 
 
 
740 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.28 
 
 
860 aa  95.5  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0220  metal dependent phosphohydrolase  31.35 
 
 
371 aa  95.5  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0629  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.96 
 
 
339 aa  95.9  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0653  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.45 
 
 
345 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6785900000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2178  metal dependent phosphohydrolase  27.64 
 
 
335 aa  95.5  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>