More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1873 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
279 aa  562  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.356461  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1951  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  49.82 
 
 
275 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194431  hitchhiker  0.0000447101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7245  Short-chain dehydrogenase/reductase  44.04 
 
 
267 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  0.817799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.41 
 
 
256 aa  156  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108701 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
257 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.2 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686827  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  34.43 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.53 
 
 
255 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38255  peroxisomal 2,4- dienoyl-CoA reductase, and sorbitol utilization protein  36.16 
 
 
282 aa  144  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 
269 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 
254 aa  143  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.78 
 
 
257 aa  142  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 
257 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563434  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
250 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29820  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  35.45 
 
 
261 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  35.47 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
257 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
258 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05340  d-arabinitol 2-dehydrogenase, putative  35.82 
 
 
355 aa  137  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.656485  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
258 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  32.84 
 
 
253 aa  136  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.93 
 
 
251 aa  135  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  33.7 
 
 
253 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  35.79 
 
 
257 aa  135  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.73 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  35.45 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.838313 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06655  short-chain dehydrogenase/reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03520)  33.95 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  35.79 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  38.43 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  35.79 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  35.79 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  35.97 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02177  short chain dehydrogenase/oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15740)  35.79 
 
 
337 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.186122 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 
253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
254 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2281  short chain dehydrogenase  34.59 
 
 
257 aa  132  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
247 aa  132  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2753  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 
260 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.53957  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.67 
 
 
264 aa  132  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3481  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.14 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187301  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  34.33 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
256 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6365  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.23 
 
 
263 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0520  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.05 
 
 
262 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
257 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.32 
 
 
248 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.59 
 
 
257 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.34144  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0249  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.58 
 
 
258 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0279472  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.59 
 
 
257 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000368197  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
257 aa  128  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.71 
 
 
252 aa  128  9.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
256 aa  128  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08819  short chain dehydrogenase (Eurofung)  35.97 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0173459  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5289  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0559291  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2919  gluconate 5-dehydrogenase  33.82 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.7 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  33.7 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2695  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  38.29 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  34.59 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.29 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.7 
 
 
250 aa  126  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182399  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 
255 aa  126  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.600374  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3769  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.42 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9124  gluconate 5-dehydrogenase  33.46 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.991877  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1800  short chain dehydrogenase  37.36 
 
 
260 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.837228 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 
257 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.7 
 
 
256 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 
257 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 
269 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 
253 aa  125  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
255 aa  125  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245481  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1513  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  38.29 
 
 
277 aa  125  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.729699 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
266 aa  125  9e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05547  conserved hypothetical protein  35.53 
 
 
283 aa  124  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
276 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4827  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
295 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  34.33 
 
 
258 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 
255 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3702  short chain dehydrogenase  34.96 
 
 
260 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.709318  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.32 
 
 
251 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0919  putative oxidoreductase  34.07 
 
 
257 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
252 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 
287 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
251 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 
259 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1800  gluconate 5-dehydrogenase  30.47 
 
 
254 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  33.83 
 
 
267 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 
259 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 
255 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
257 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 
259 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  30.63 
 
 
257 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>