More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0774 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0774  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  100 
 
 		 361 aa  723    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2398  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  42.6 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.940863  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2999  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.83 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1817  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.55 
 
 		 349 aa  225  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.466899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1430  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  41.81 
 
 		 366 aa  225  8e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0230431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1871  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  42.24 
 
 		 358 aa  220  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4598  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  40.95 
 
 		 376 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4251  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  42.9 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.731612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4115  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.58 
 
 		 379 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.105278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0496  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  40.17 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.150259  normal  0.194541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0229  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.29 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3265  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  40.85 
 
 		 678 aa  206  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1305  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.66 
 
 		 379 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3346  L-lactate dehydrogenase  34.69 
 
 		 379 aa  204  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3916  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.03 
 
 		 379 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2057  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  39.58 
 
 		 370 aa  202  7e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3519  L-lactate dehydrogenase  35.23 
 
 		 378 aa  202  8e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001223  L-lactate dehydrogenase  34.9 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1112  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.11 
 
 		 381 aa  200  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0089  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.46 
 
 		 391 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442133  normal  0.763555 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3635  L-lactate dehydrogenase  36.76 
 
 		 379 aa  199  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2344  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.9 
 
 		 395 aa  199  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4800  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.51 
 
 		 379 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1462  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.67 
 
 		 352 aa  199  7e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0238326  normal  0.034718 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1959  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.95 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548069  normal  0.0478 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4638  L-lactate dehydrogenase  36.46 
 
 		 384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1371  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.24 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1816  putative L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.36 
 
 		 378 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4080  L-lactate dehydrogenase  35.05 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1696  L-lactate dehydrogenase  35.5 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0334813 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3911  L-lactate dehydrogenase  35.05 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2409  L-lactate dehydrogenase  35.5 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2506  L-lactate dehydrogenase  35.5 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4109  L-lactate dehydrogenase  34.89 
 
 		 396 aa  193  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3895  L-lactate dehydrogenase  35.05 
 
 		 396 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3942  L-lactate dehydrogenase  34.89 
 
 		 396 aa  193  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4978  L-lactate dehydrogenase  34.89 
 
 		 396 aa  193  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5294  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.56 
 
 		 391 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03463  L-lactate dehydrogenase, FMN-linked  34.89 
 
 		 396 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0100  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.89 
 
 		 396 aa  193  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4031  L-lactate dehydrogenase  34.89 
 
 		 396 aa  193  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2879  L-lactate dehydrogenase  35.45 
 
 		 383 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03414  hypothetical protein  34.89 
 
 		 396 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4018  L-lactate dehydrogenase  35.05 
 
 		 396 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3817  L-lactate dehydrogenase  34.89 
 
 		 396 aa  193  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1331  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.48 
 
 		 385 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0103  L-lactate dehydrogenase  34.89 
 
 		 396 aa  193  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2351  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.98 
 
 		 385 aa  192  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4132  L-lactate dehydrogenase  34.89 
 
 		 386 aa  192  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0404  L-lactate dehydrogenase  34.42 
 
 		 392 aa  192  6e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5795  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.41 
 
 		 383 aa  192  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.821423 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3973  L-lactate dehydrogenase  34.78 
 
 		 396 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0695  L-lactate dehydrogenase  34.96 
 
 		 381 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000139507 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0130  L-lactate dehydrogenase  34.51 
 
 		 395 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33860  L-lactate dehydrogenase  34.92 
 
 		 383 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.14557 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0920  L-lactate dehydrogenase  33.51 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0862  L-lactate dehydrogenase  33.51 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.27299  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3049  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.18 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0908  L-lactate dehydrogenase  33.7 
 
 		 380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5491  L-lactate dehydrogenase  34.32 
 
 		 381 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316989  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2360  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.78 
 
 		 379 aa  189  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4737  L-lactate dehydrogenase  34.96 
 
 		 381 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4736  L-lactate dehydrogenase  34.69 
 
 		 381 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4602  L-lactate dehydrogenase  34.69 
 
 		 381 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0515412  normal  0.0177303 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1050  L-lactate dehydrogenase  34.05 
 
 		 381 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0905  Lactate 2-monooxygenase  35.33 
 
 		 388 aa  188  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1448  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.25 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0254  L-lactate dehydrogenase  34.62 
 
 		 378 aa  187  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4413  L-lactate dehydrogenase  34.15 
 
 		 386 aa  186  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63090  L-lactate dehydrogenase  34.05 
 
 		 381 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0242094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4493  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.16 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.14596 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2651  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.05 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2875  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  32.81 
 
 		 380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189587  normal  0.0992837 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3298  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  34.05 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.355781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3143  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  32.18 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3154  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.05 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03463  L-lactate dehydrogenase  34.32 
 
 		 388 aa  184  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17191  L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent)-like alpha-hydroxy acid dehydrogenases  30.13 
 
 		 390 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3845  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  35.71 
 
 		 397 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2872  putative L-lactate dehydrogenase  35.48 
 
 		 380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.279679  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2990  putative L-lactate dehydrogenase  35.48 
 
 		 380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.181146  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1563  L-lactate dehydrogenase  35.48 
 
 		 380 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0374  L-lactate dehydrogenase  35.48 
 
 		 380 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0688982  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1750  L-lactate dehydrogenase  35.48 
 
 		 380 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1229  L-lactate dehydrogenase  35.48 
 
 		 380 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0499523  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0415  L-lactate dehydrogenase  35.48 
 
 		 380 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.596015  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2077  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.56 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2463  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.82 
 
 		 348 aa  182  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283428  normal  0.44924 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2905  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.11 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3608  L-lactate dehydrogenase  36.66 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3487  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.24 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323095  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2810  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.02 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3188  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  37.8 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.054684  hitchhiker  0.0000508135 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5754  L-lactate dehydrogenase  32.71 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202266  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12350  L-lactate dehydrogenase/FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.48 
 
 		 371 aa  179  7e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.205767  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0350  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.82 
 
 		 387 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673391  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6648  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.96 
 
 		 391 aa  179  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0123873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4852  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.55 
 
 		 440 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00125514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0804  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  36.86 
 
 		 389 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4075  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.51 
 
 		 387 aa  176  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72179  normal  0.076317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>