47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4761 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4761  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  462  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.462607  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4321  hypothetical protein  90.78 
 
 
228 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1234  hypothetical protein  46.81 
 
 
234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.140849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2525  hypothetical protein  50.73 
 
 
229 aa  158  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1958  hypothetical protein  48.45 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.617647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1956  protein of unknown function DUF105  30.4 
 
 
245 aa  92  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0789026  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  29.38 
 
 
494 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2352  hypothetical protein  36.56 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  32.83 
 
 
490 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0140  protein of unknown function DUF105  40.35 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.499226 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3636  hypothetical protein  29.47 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0492  hypothetical protein  37.65 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0181  hypothetical protein  30.62 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.808143  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1230  hypothetical protein  38 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842222  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0705  hypothetical protein  27.86 
 
 
296 aa  64.7  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.987141  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2500  Adenosylcobinamide hydrolase  34.63 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.024288  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1007  protein of unknown function DUF105  27.4 
 
 
386 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1672  hypothetical protein  29.83 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0106952  hitchhiker  0.00000000163355 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2681  hypothetical protein  29.91 
 
 
239 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525327  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_69  CbiZ-like protein  28.57 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0249  hypothetical protein  28.57 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0363735  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2838  Adenosylcobinamide hydrolase  32.65 
 
 
255 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1368  hypothetical protein  27.96 
 
 
213 aa  56.2  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0645  hypothetical protein  26.37 
 
 
358 aa  54.3  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2543  hypothetical protein  27.06 
 
 
303 aa  52.8  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1295  protein of unknown function DUF105  26.47 
 
 
393 aa  51.6  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41325  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4452  hypothetical protein  34.73 
 
 
219 aa  52  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.815722  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0271  hypothetical protein  32.89 
 
 
372 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.826934  normal  0.0239452 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1265  hypothetical protein  36.67 
 
 
385 aa  49.7  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00387767  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0993  hypothetical protein  27.27 
 
 
254 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_591  CbiZ-like protein  35.56 
 
 
256 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.78364  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0102  hypothetical protein  27.27 
 
 
254 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00649949  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1556  hypothetical protein  27.27 
 
 
254 aa  49.7  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00339974  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0992  Adenosylcobinamide hydrolase  30.34 
 
 
288 aa  49.3  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389903  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0123  hypothetical protein  25.13 
 
 
255 aa  48.5  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131423  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1001  hypothetical protein  27.95 
 
 
369 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0314  hypothetical protein  27.84 
 
 
260 aa  47  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0623  hypothetical protein  33.33 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.728752  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0687  hypothetical protein  34.44 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0653  hypothetical protein  34.44 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1165  hypothetical protein  27.32 
 
 
260 aa  46.2  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.136432  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1356  CbiZ domain protein  26.92 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2406  hypothetical protein  32.74 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1086  hypothetical protein  34.41 
 
 
175 aa  43.5  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4761  hypothetical protein  32.95 
 
 
241 aa  42.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529649  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1069  hypothetical protein  32.21 
 
 
219 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482979  normal  0.873329 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2743  hypothetical protein  29.53 
 
 
700 aa  42  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>