36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1265 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1265  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  793    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00387767  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1007  protein of unknown function DUF105  53.83 
 
 
386 aa  387  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1295  protein of unknown function DUF105  53.05 
 
 
393 aa  380  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41325  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1001  hypothetical protein  36.57 
 
 
369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0271  hypothetical protein  39.38 
 
 
372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.826934  normal  0.0239452 
 
 
-
 
NC_002950  PG0645  hypothetical protein  37.79 
 
 
358 aa  176  6e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2743  hypothetical protein  33.33 
 
 
700 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1230  hypothetical protein  42.19 
 
 
282 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842222  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0123  hypothetical protein  32.67 
 
 
255 aa  99.8  8e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131423  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0653  hypothetical protein  39.18 
 
 
256 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0687  hypothetical protein  39.18 
 
 
256 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_591  CbiZ-like protein  38.6 
 
 
256 aa  92.8  8e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.78364  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0623  hypothetical protein  37.43 
 
 
256 aa  91.3  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.728752  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0993  hypothetical protein  37.13 
 
 
254 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0102  hypothetical protein  37.13 
 
 
254 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00649949  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1556  hypothetical protein  36.53 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00339974  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0314  hypothetical protein  34.73 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1165  hypothetical protein  34.13 
 
 
260 aa  82.4  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.136432  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_69  CbiZ-like protein  35.58 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1356  CbiZ domain protein  34.13 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0249  hypothetical protein  35.58 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0363735  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0242  hypothetical protein  33.33 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0895738  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_76  adenosylcobinamide amidohydrolase, CbiZ  33.33 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  33.33 
 
 
494 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1956  protein of unknown function DUF105  30.23 
 
 
245 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0789026  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  32.92 
 
 
490 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2352  hypothetical protein  27.6 
 
 
297 aa  61.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2681  hypothetical protein  32.7 
 
 
239 aa  60.5  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525327  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4321  hypothetical protein  36.54 
 
 
228 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0492  hypothetical protein  31.69 
 
 
250 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4452  hypothetical protein  39.13 
 
 
219 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.815722  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4761  hypothetical protein  44.32 
 
 
241 aa  50.4  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529649  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4761  hypothetical protein  36.67 
 
 
238 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.462607  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2543  hypothetical protein  26.84 
 
 
303 aa  46.6  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1386  hypothetical protein  40.66 
 
 
214 aa  46.2  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.122063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1958  hypothetical protein  32.28 
 
 
252 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.617647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>