37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0623 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0623  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  524  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.728752  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0653  hypothetical protein  94.14 
 
 
256 aa  498  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0687  hypothetical protein  94.14 
 
 
256 aa  498  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_591  CbiZ-like protein  92.58 
 
 
256 aa  489  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.78364  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1356  CbiZ domain protein  49.79 
 
 
255 aa  236  2e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1165  hypothetical protein  48.74 
 
 
260 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.136432  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0314  hypothetical protein  48.32 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0102  hypothetical protein  49.36 
 
 
254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00649949  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0993  hypothetical protein  48.93 
 
 
254 aa  231  1e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1556  hypothetical protein  47.18 
 
 
254 aa  228  6e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00339974  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_69  CbiZ-like protein  46.09 
 
 
268 aa  218  7e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0249  hypothetical protein  45.27 
 
 
268 aa  215  5e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0363735  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0242  hypothetical protein  37.35 
 
 
259 aa  187  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0895738  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_76  adenosylcobinamide amidohydrolase, CbiZ  37.65 
 
 
259 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0123  hypothetical protein  34.48 
 
 
255 aa  155  6e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131423  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1230  hypothetical protein  35.54 
 
 
282 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2743  hypothetical protein  36.05 
 
 
700 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1295  protein of unknown function DUF105  40.57 
 
 
393 aa  106  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41325  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1265  hypothetical protein  37.43 
 
 
385 aa  91.3  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00387767  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1007  protein of unknown function DUF105  42.58 
 
 
386 aa  91.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0645  hypothetical protein  35.4 
 
 
358 aa  86.7  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1001  hypothetical protein  33.89 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0271  hypothetical protein  35.85 
 
 
372 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.826934  normal  0.0239452 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  33.33 
 
 
494 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1956  protein of unknown function DUF105  33.75 
 
 
245 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0789026  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4452  hypothetical protein  28.37 
 
 
219 aa  56.6  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.815722  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  38.13 
 
 
490 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0492  hypothetical protein  30.6 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1386  hypothetical protein  28.95 
 
 
214 aa  52  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.122063 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2406  hypothetical protein  29.44 
 
 
219 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4761  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  49.3  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529649  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1069  hypothetical protein  31.69 
 
 
219 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482979  normal  0.873329 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4321  hypothetical protein  34.04 
 
 
228 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4761  hypothetical protein  33.33 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.462607  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2681  hypothetical protein  38.78 
 
 
239 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525327  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0140  protein of unknown function DUF105  26.92 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.499226 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0181  hypothetical protein  26.67 
 
 
296 aa  42  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.808143  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>