29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0242 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0242  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  541  1e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0895738  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_76  adenosylcobinamide amidohydrolase, CbiZ  99.61 
 
 		 259 aa  539  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0993  hypothetical protein  50.21 
 
 		 254 aa  246  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0102  hypothetical protein  50.21 
 
 		 254 aa  247  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00649949  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1556  hypothetical protein  49.79 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00339974  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1356  CbiZ domain protein  48.4 
 
 		 255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0314  hypothetical protein  48.4 
 
 		 260 aa  238  6.999999999999999e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1165  hypothetical protein  48 
 
 		 260 aa  237  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.136432  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0653  hypothetical protein  38.46 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0687  hypothetical protein  38.46 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0623  hypothetical protein  37.35 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.728752  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_591  CbiZ-like protein  37.86 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.78364  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_69  CbiZ-like protein  39.57 
 
 		 268 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0249  hypothetical protein  39.15 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0363735  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0123  hypothetical protein  35.37 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131423  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2743  hypothetical protein  33.19 
 
 		 700 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1230  hypothetical protein  33.19 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842222  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1295  protein of unknown function DUF105  36 
 
 		 393 aa  90.5  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1007  protein of unknown function DUF105  31.09 
 
 		 386 aa  82  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1265  hypothetical protein  33.33 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00387767  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0645  hypothetical protein  31.03 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1001  hypothetical protein  30.72 
 
 		 369 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0271  hypothetical protein  29.75 
 
 		 372 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.826934  normal  0.0239452 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  32.3 
 
 		 490 aa  52.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  30.82 
 
 		 494 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2681  hypothetical protein  38.04 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525327  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0492  hypothetical protein  33.9 
 
 		 250 aa  48.9  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0705  hypothetical protein  31.03 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.987141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3636  hypothetical protein  31.37 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>