44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1230 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1230  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842222  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0123  hypothetical protein  38.33 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131423  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0653  hypothetical protein  36.36 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0687  hypothetical protein  36.36 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2743  hypothetical protein  39.11 
 
 		 700 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0102  hypothetical protein  37.17 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00649949  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0993  hypothetical protein  37.17 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0623  hypothetical protein  35.54 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.728752  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_591  CbiZ-like protein  35.95 
 
 		 256 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.78364  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1556  hypothetical protein  36.73 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00339974  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1356  CbiZ domain protein  35.84 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_69  CbiZ-like protein  38.12 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1001  hypothetical protein  39.15 
 
 		 369 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0249  hypothetical protein  38.12 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0363735  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0314  hypothetical protein  35.4 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1165  hypothetical protein  34.96 
 
 		 260 aa  127  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.136432  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1295  protein of unknown function DUF105  37.8 
 
 		 393 aa  117  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1265  hypothetical protein  42.19 
 
 		 385 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00387767  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1007  protein of unknown function DUF105  39.43 
 
 		 386 aa  116  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0242  hypothetical protein  33.19 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0895738  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_76  adenosylcobinamide amidohydrolase, CbiZ  33.19 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0645  hypothetical protein  36.52 
 
 		 358 aa  99  8e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0271  hypothetical protein  36.48 
 
 		 372 aa  98.2  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.826934  normal  0.0239452 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  39.86 
 
 		 490 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  35.09 
 
 		 494 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0492  hypothetical protein  33.33 
 
 		 250 aa  75.5  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4761  hypothetical protein  42.4 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4321  hypothetical protein  39.36 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2543  hypothetical protein  32.32 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4761  hypothetical protein  38 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.462607  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2681  hypothetical protein  35.25 
 
 		 239 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525327  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1234  hypothetical protein  36.67 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.140849 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1956  protein of unknown function DUF105  31.97 
 
 		 245 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0789026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2525  hypothetical protein  34.09 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1386  hypothetical protein  29.26 
 
 		 214 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.122063 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0705  hypothetical protein  30.14 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.987141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4452  hypothetical protein  28.57 
 
 		 219 aa  52.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.815722  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2352  hypothetical protein  30.52 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1069  hypothetical protein  30.36 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482979  normal  0.873329 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1368  hypothetical protein  27.67 
 
 		 213 aa  48.9  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3636  hypothetical protein  29.41 
 
 		 200 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2406  hypothetical protein  29.91 
 
 		 219 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1672  hypothetical protein  28.57 
 
 		 307 aa  45.8  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0106952  hitchhiker  0.00000000163355 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0140  protein of unknown function DUF105  29.33 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.499226 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>