30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0249 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0249  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0363735  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_69  CbiZ-like protein  97.39 
 
 
268 aa  544  1e-154  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0623  hypothetical protein  45.27 
 
 
256 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.728752  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0653  hypothetical protein  44.44 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0687  hypothetical protein  44.44 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_591  CbiZ-like protein  44.44 
 
 
256 aa  211  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.78364  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0314  hypothetical protein  43.28 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1165  hypothetical protein  42.86 
 
 
260 aa  199  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.136432  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1356  CbiZ domain protein  41.18 
 
 
255 aa  190  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0993  hypothetical protein  41.18 
 
 
254 aa  190  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0102  hypothetical protein  40.76 
 
 
254 aa  189  5e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00649949  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1556  hypothetical protein  40.76 
 
 
254 aa  188  8e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00339974  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0242  hypothetical protein  39.15 
 
 
259 aa  171  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0895738  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_76  adenosylcobinamide amidohydrolase, CbiZ  39.15 
 
 
259 aa  170  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0123  hypothetical protein  34.48 
 
 
255 aa  143  3e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131423  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1230  hypothetical protein  37.67 
 
 
282 aa  128  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2743  hypothetical protein  31.91 
 
 
700 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1295  protein of unknown function DUF105  30.21 
 
 
393 aa  88.2  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41325  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1007  protein of unknown function DUF105  31.78 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1265  hypothetical protein  35.58 
 
 
385 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00387767  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1001  hypothetical protein  35.53 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0645  hypothetical protein  34.78 
 
 
358 aa  66.2  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0271  hypothetical protein  32.45 
 
 
372 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.826934  normal  0.0239452 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  31.64 
 
 
494 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4321  hypothetical protein  27.6 
 
 
228 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4761  hypothetical protein  28.57 
 
 
238 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.462607  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2543  hypothetical protein  30.77 
 
 
303 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  27.87 
 
 
490 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0492  hypothetical protein  31.9 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3636  hypothetical protein  25 
 
 
200 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>