41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2352 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2352  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  617  1e-176  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0705  hypothetical protein  56.23 
 
 
296 aa  347  1e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.987141  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0181  hypothetical protein  58.76 
 
 
296 aa  337  9.999999999999999e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.808143  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2543  hypothetical protein  48.52 
 
 
303 aa  291  7e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1672  hypothetical protein  44.13 
 
 
307 aa  276  3e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0106952  hitchhiker  0.00000000163355 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0026  cysteine-rich small domain protein  37.62 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3636  hypothetical protein  43.43 
 
 
200 aa  146  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0101  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  53.95 
 
 
341 aa  99.8  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  34.29 
 
 
496 aa  89  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1233  hypothetical protein  53.57 
 
 
122 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  47.46 
 
 
498 aa  79.3  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1442  hypothetical protein  53.57 
 
 
122 aa  79  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.263139  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1958  hypothetical protein  36.9 
 
 
252 aa  77  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.617647  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1244  hypothetical protein  53.57 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0722  hypothetical protein  50.82 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4761  hypothetical protein  34.95 
 
 
238 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.462607  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4321  hypothetical protein  35.38 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0934  hypothetical protein  51.79 
 
 
124 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1956  protein of unknown function DUF105  29.69 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0789026  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  42.86 
 
 
498 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2424  protein of unknown function DUF105  37.39 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142271  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1265  hypothetical protein  27.6 
 
 
385 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00387767  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2525  hypothetical protein  34.27 
 
 
229 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0140  protein of unknown function DUF105  33.52 
 
 
241 aa  58.5  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.499226 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1001  hypothetical protein  24 
 
 
369 aa  58.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  29.56 
 
 
494 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  33.53 
 
 
490 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1234  hypothetical protein  31.25 
 
 
234 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.140849 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1007  protein of unknown function DUF105  26.6 
 
 
386 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2500  Adenosylcobinamide hydrolase  30.33 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.024288  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1086  hypothetical protein  35.05 
 
 
175 aa  53.5  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1230  hypothetical protein  30.52 
 
 
282 aa  52.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842222  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0271  hypothetical protein  25.51 
 
 
372 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.826934  normal  0.0239452 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1386  hypothetical protein  32.65 
 
 
214 aa  49.3  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.122063 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1368  hypothetical protein  25.85 
 
 
213 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1295  protein of unknown function DUF105  24.07 
 
 
393 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41325  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4761  hypothetical protein  32.81 
 
 
241 aa  46.6  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529649  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2743  hypothetical protein  30.14 
 
 
700 aa  46.2  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2838  Adenosylcobinamide hydrolase  28.37 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0645  hypothetical protein  28.1 
 
 
358 aa  44.3  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0492  hypothetical protein  32 
 
 
250 aa  42.7  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>