35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1386 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1386  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.122063 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1069  hypothetical protein  76.78 
 
 		 219 aa  308  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482979  normal  0.873329 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2406  hypothetical protein  75.36 
 
 		 219 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4761  hypothetical protein  56.87 
 
 		 241 aa  207  9e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4452  hypothetical protein  46.38 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.815722  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0492  hypothetical protein  45.07 
 
 		 250 aa  149  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  32.85 
 
 		 494 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  37.11 
 
 		 490 aa  72.8  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1956  protein of unknown function DUF105  28.11 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0789026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2500  Adenosylcobinamide hydrolase  45.65 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.024288  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1234  hypothetical protein  31.55 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.140849 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1230  hypothetical protein  28.9 
 
 		 282 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842222  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1001  hypothetical protein  28.93 
 
 		 369 aa  52.4  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0623  hypothetical protein  28.95 
 
 		 256 aa  52  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.728752  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0645  hypothetical protein  36.36 
 
 		 358 aa  50.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3636  hypothetical protein  29.57 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_591  CbiZ-like protein  31.58 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.78364  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2525  hypothetical protein  32.9 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0181  hypothetical protein  34.62 
 
 		 296 aa  50.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.808143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1007  protein of unknown function DUF105  37.5 
 
 		 386 aa  49.7  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0271  hypothetical protein  38.78 
 
 		 372 aa  49.3  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.826934  normal  0.0239452 
 
 
-
 
NC_002936  DET0687  hypothetical protein  30.41 
 
 		 256 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0653  hypothetical protein  30.41 
 
 		 256 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1295  protein of unknown function DUF105  36.54 
 
 		 393 aa  48.9  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2681  hypothetical protein  27.68 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525327  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0123  hypothetical protein  31.82 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131423  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4321  hypothetical protein  33.83 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1265  hypothetical protein  40.66 
 
 		 385 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00387767  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1368  hypothetical protein  29.71 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0314  hypothetical protein  26.24 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2743  hypothetical protein  28.09 
 
 		 700 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1165  hypothetical protein  25.74 
 
 		 260 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.136432  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1356  CbiZ domain protein  26.96 
 
 		 255 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_76  adenosylcobinamide amidohydrolase, CbiZ  27.62 
 
 		 259 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0242  hypothetical protein  33.01 
 
 		 259 aa  41.6  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0895738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>