45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3636 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3636  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  402  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2352  hypothetical protein  43.43 
 
 
297 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0705  hypothetical protein  43.46 
 
 
296 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.987141  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0181  hypothetical protein  42.05 
 
 
296 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.808143  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2543  hypothetical protein  38.16 
 
 
303 aa  123  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1672  hypothetical protein  34.18 
 
 
307 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0106952  hitchhiker  0.00000000163355 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1958  hypothetical protein  30.51 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.617647  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4321  hypothetical protein  30.96 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1956  protein of unknown function DUF105  29.09 
 
 
245 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0789026  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2525  hypothetical protein  28.5 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4761  hypothetical protein  29.02 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.462607  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1234  hypothetical protein  27.72 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.140849 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1001  hypothetical protein  31.2 
 
 
369 aa  61.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1368  hypothetical protein  29.35 
 
 
213 aa  58.9  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0140  protein of unknown function DUF105  24.54 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.499226 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2500  Adenosylcobinamide hydrolase  25.12 
 
 
243 aa  56.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.024288  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  27.23 
 
 
494 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  27.09 
 
 
490 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2838  Adenosylcobinamide hydrolase  27.86 
 
 
255 aa  51.6  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1386  hypothetical protein  29.57 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.122063 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0992  Adenosylcobinamide hydrolase  23.5 
 
 
288 aa  49.3  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389903  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0102  hypothetical protein  27.78 
 
 
254 aa  48.9  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00649949  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2681  hypothetical protein  31.97 
 
 
239 aa  48.9  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525327  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1230  hypothetical protein  29.41 
 
 
282 aa  48.9  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842222  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0492  hypothetical protein  28 
 
 
250 aa  48.1  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0993  hypothetical protein  28.17 
 
 
254 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1533  hypothetical protein  34.38 
 
 
337 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00901937 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2743  hypothetical protein  31.33 
 
 
700 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1556  hypothetical protein  28.17 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00339974  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0314  hypothetical protein  28.17 
 
 
260 aa  47  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1165  hypothetical protein  27.7 
 
 
260 aa  45.8  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.136432  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1295  protein of unknown function DUF105  27.03 
 
 
393 aa  45.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41325  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0271  hypothetical protein  31.9 
 
 
372 aa  45.1  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.826934  normal  0.0239452 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_76  adenosylcobinamide amidohydrolase, CbiZ  31.37 
 
 
259 aa  45.1  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0242  hypothetical protein  31.37 
 
 
259 aa  45.1  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0895738  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1356  CbiZ domain protein  28.17 
 
 
255 aa  45.1  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4452  hypothetical protein  27.65 
 
 
219 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.815722  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0249  hypothetical protein  25 
 
 
268 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0363735  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_69  CbiZ-like protein  25 
 
 
268 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1069  hypothetical protein  29.52 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482979  normal  0.873329 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0123  hypothetical protein  33.01 
 
 
255 aa  43.1  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131423  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2406  hypothetical protein  28.66 
 
 
219 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2424  protein of unknown function DUF105  32.41 
 
 
180 aa  42.4  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142271  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4761  hypothetical protein  23.03 
 
 
241 aa  42  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529649  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0623  hypothetical protein  28.48 
 
 
256 aa  41.2  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.728752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>