22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1533 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1533  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  673    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00901937 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0302  hypothetical protein  37.75 
 
 
326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00317045  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1367  hypothetical protein  37.75 
 
 
329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000128086  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1016  hypothetical protein  34.58 
 
 
152 aa  73.9  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3455  hypothetical protein  31.78 
 
 
180 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2091  hypothetical protein  28.23 
 
 
195 aa  60.8  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2543  hypothetical protein  34.16 
 
 
303 aa  56.2  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1368  hypothetical protein  28.57 
 
 
213 aa  55.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2424  protein of unknown function DUF105  38.28 
 
 
180 aa  53.1  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142271  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1086  hypothetical protein  35.57 
 
 
175 aa  53.5  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  37.61 
 
 
490 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1956  protein of unknown function DUF105  28.72 
 
 
245 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0789026  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1489  phosphatidylglycerophosphatase A  31.19 
 
 
147 aa  52  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1549  phosphatidylglycerophosphatase A  34.86 
 
 
144 aa  50.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0702  phosphatidylglycerophosphatase A  31.78 
 
 
144 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.267092 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1812  phosphatidylglycerophosphatase A  30.19 
 
 
147 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3636  hypothetical protein  34.38 
 
 
200 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2681  hypothetical protein  29.93 
 
 
239 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525327  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0844  phosphatidylglycerophosphatase A  26.89 
 
 
162 aa  46.2  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.296351  normal  0.171792 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1073  phosphatidylglycerophosphatase A  30.3 
 
 
162 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4452  hypothetical protein  33.61 
 
 
219 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.815722  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0909  phosphatidylglycerophosphatase A  30.53 
 
 
162 aa  42.7  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>