25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1812 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1812  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 
147 aa  298  1e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0844  phosphatidylglycerophosphatase A  96.6 
 
 
162 aa  295  1e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.296351  normal  0.171792 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1073  phosphatidylglycerophosphatase A  95.92 
 
 
162 aa  292  1e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0909  phosphatidylglycerophosphatase A  82.99 
 
 
162 aa  259  1e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1489  phosphatidylglycerophosphatase A  64.34 
 
 
147 aa  201  3e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1549  phosphatidylglycerophosphatase A  37.59 
 
 
144 aa  102  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0702  phosphatidylglycerophosphatase A  35.04 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.267092 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1016  hypothetical protein  31.76 
 
 
152 aa  90.5  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0734  phosphatidylglycerophosphatase A  34.51 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3455  hypothetical protein  28.38 
 
 
180 aa  80.5  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2091  hypothetical protein  37.29 
 
 
195 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1367  hypothetical protein  28.95 
 
 
329 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000128086  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0302  hypothetical protein  28.07 
 
 
326 aa  55.5  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00317045  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1533  hypothetical protein  30.19 
 
 
337 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00901937 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1369  phosphatidylglycerophosphatase A or related protein  28.35 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0242  phosphatidylglycerophosphatase A  40.26 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1597  phosphatidylglycerophosphatase A  35.42 
 
 
166 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3014  phosphatidylglycerophosphatase A  39.34 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0025  phosphatidylglycerophosphatase A  32.45 
 
 
165 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.6081  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0105  phosphatidylglycerophosphatase A  37.68 
 
 
166 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000396476  hitchhiker  0.00000000000225664 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1782  phosphatidylglycerophosphatase A  35.42 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0199  phosphatidylglycerophosphatase A  39.19 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1964  phosphatidylglycerophosphatase A  34.38 
 
 
166 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1490  phosphatidylglycerophosphatase A  45.24 
 
 
168 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1464  phosphatidylglycerophosphatase A  35.53 
 
 
155 aa  40  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>