15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2424 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2424  protein of unknown function DUF105  100 
 
 
180 aa  368  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142271  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1086  hypothetical protein  63.95 
 
 
175 aa  231  4.0000000000000004e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2352  hypothetical protein  37.39 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0705  hypothetical protein  36.13 
 
 
296 aa  63.9  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.987141  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2543  hypothetical protein  37.39 
 
 
303 aa  58.9  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1533  hypothetical protein  38.28 
 
 
337 aa  53.1  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00901937 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1368  hypothetical protein  32.64 
 
 
213 aa  52  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1234  hypothetical protein  41.98 
 
 
234 aa  50.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.140849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1958  hypothetical protein  53.7 
 
 
252 aa  49.3  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.617647  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2525  hypothetical protein  41.77 
 
 
229 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2681  hypothetical protein  29.22 
 
 
239 aa  48.5  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525327  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0181  hypothetical protein  32.71 
 
 
296 aa  48.1  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.808143  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3636  hypothetical protein  32.41 
 
 
200 aa  42.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1295  protein of unknown function DUF105  32.32 
 
 
393 aa  42.4  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41325  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1672  hypothetical protein  28.32 
 
 
307 aa  42  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0106952  hitchhiker  0.00000000163355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>