36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2525 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2525  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1234  hypothetical protein  66.08 
 
 
234 aa  268  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.140849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1958  hypothetical protein  54.67 
 
 
252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.617647  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4321  hypothetical protein  48.8 
 
 
228 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4761  hypothetical protein  50.73 
 
 
238 aa  154  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.462607  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1956  protein of unknown function DUF105  30.19 
 
 
245 aa  85.5  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0789026  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3636  hypothetical protein  28.5 
 
 
200 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2681  hypothetical protein  33.33 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525327  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0492  hypothetical protein  32.74 
 
 
250 aa  67  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  30.73 
 
 
494 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2352  hypothetical protein  34.64 
 
 
297 aa  62  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4761  hypothetical protein  34.64 
 
 
241 aa  61.6  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529649  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2543  hypothetical protein  31.22 
 
 
303 aa  60.1  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0140  protein of unknown function DUF105  32.97 
 
 
241 aa  59.7  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.499226 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0705  hypothetical protein  31.55 
 
 
296 aa  59.3  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.987141  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1672  hypothetical protein  43.75 
 
 
307 aa  58.5  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0106952  hitchhiker  0.00000000163355 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  30.99 
 
 
490 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1230  hypothetical protein  34.09 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842222  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1386  hypothetical protein  32.9 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.122063 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2424  protein of unknown function DUF105  27.57 
 
 
180 aa  51.2  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142271  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2406  hypothetical protein  35.65 
 
 
219 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4452  hypothetical protein  31.98 
 
 
219 aa  49.3  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.815722  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1069  hypothetical protein  32.67 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482979  normal  0.873329 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0123  hypothetical protein  29.01 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131423  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1295  protein of unknown function DUF105  32.22 
 
 
393 aa  45.8  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41325  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0181  hypothetical protein  29.03 
 
 
296 aa  45.8  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.808143  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1086  hypothetical protein  43.04 
 
 
175 aa  45.4  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2500  Adenosylcobinamide hydrolase  37.8 
 
 
243 aa  45.4  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.024288  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0623  hypothetical protein  27.54 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.728752  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_591  CbiZ-like protein  26.95 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.78364  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1001  hypothetical protein  25.23 
 
 
369 aa  43.5  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1368  hypothetical protein  33.33 
 
 
213 aa  43.5  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0992  Adenosylcobinamide hydrolase  41.25 
 
 
288 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389903  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2743  hypothetical protein  28.3 
 
 
700 aa  42  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0687  hypothetical protein  26.35 
 
 
256 aa  42  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0653  hypothetical protein  26.35 
 
 
256 aa  42  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>