28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0140 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0140  protein of unknown function DUF105  100 
 
 
241 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.499226 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0236  protein of unknown function DUF105  56.5 
 
 
248 aa  215  4e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.926355  normal  0.451743 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2838  Adenosylcobinamide hydrolase  55.79 
 
 
255 aa  212  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2500  Adenosylcobinamide hydrolase  50.63 
 
 
243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.024288  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0992  Adenosylcobinamide hydrolase  47.71 
 
 
288 aa  196  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389903  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0705  hypothetical protein  32.37 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.987141  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4321  hypothetical protein  37.79 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4761  hypothetical protein  37.85 
 
 
238 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.462607  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1958  hypothetical protein  36.6 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.617647  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2352  hypothetical protein  33.52 
 
 
297 aa  58.5  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3636  hypothetical protein  24.54 
 
 
200 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2525  hypothetical protein  32.97 
 
 
229 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1956  protein of unknown function DUF105  28.16 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0789026  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1672  hypothetical protein  29.24 
 
 
307 aa  53.5  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0106952  hitchhiker  0.00000000163355 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  26.37 
 
 
494 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1368  hypothetical protein  34.88 
 
 
213 aa  52  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0181  hypothetical protein  27.72 
 
 
296 aa  50.4  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.808143  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2543  hypothetical protein  27.07 
 
 
303 aa  49.7  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4761  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  48.9  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529649  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  28.06 
 
 
490 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_591  CbiZ-like protein  26.79 
 
 
256 aa  46.2  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.78364  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0687  hypothetical protein  26.79 
 
 
256 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0653  hypothetical protein  26.79 
 
 
256 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1234  hypothetical protein  28.73 
 
 
234 aa  45.4  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.140849 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0623  hypothetical protein  26.92 
 
 
256 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.728752  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0492  hypothetical protein  32.8 
 
 
250 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1230  hypothetical protein  29.33 
 
 
282 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842222  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2681  hypothetical protein  31.58 
 
 
239 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>