35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1672 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1672  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  642    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0106952  hitchhiker  0.00000000163355 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2352  hypothetical protein  44.13 
 
 
297 aa  276  3e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0705  hypothetical protein  41.21 
 
 
296 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.987141  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0181  hypothetical protein  41.97 
 
 
296 aa  229  6e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.808143  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2543  hypothetical protein  38.96 
 
 
303 aa  211  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0026  cysteine-rich small domain protein  34.42 
 
 
285 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3636  hypothetical protein  34.18 
 
 
200 aa  109  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0101  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  54.67 
 
 
341 aa  99.4  7e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1442  hypothetical protein  46.15 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.263139  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1233  hypothetical protein  50.82 
 
 
122 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0934  hypothetical protein  54.84 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  48.39 
 
 
498 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  49.18 
 
 
496 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1244  hypothetical protein  49.18 
 
 
122 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0722  hypothetical protein  42.11 
 
 
122 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  47.54 
 
 
498 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4321  hypothetical protein  29.47 
 
 
228 aa  63.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4761  hypothetical protein  29.83 
 
 
238 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.462607  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1234  hypothetical protein  43.02 
 
 
234 aa  59.7  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.140849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2525  hypothetical protein  43.75 
 
 
229 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  28.99 
 
 
494 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0140  protein of unknown function DUF105  29.24 
 
 
241 aa  53.5  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.499226 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  37.11 
 
 
490 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1958  hypothetical protein  29.11 
 
 
252 aa  50.8  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.617647  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1230  hypothetical protein  28.57 
 
 
282 aa  46.6  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842222  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21220  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.82 
 
 
481 aa  46.6  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.982335  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0070  cysteine-rich small domain protein  40 
 
 
95 aa  45.8  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1368  hypothetical protein  28.79 
 
 
213 aa  45.4  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2979  cysteine-rich small domain protein  41.51 
 
 
101 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1956  protein of unknown function DUF105  24.41 
 
 
245 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0789026  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2681  hypothetical protein  31.91 
 
 
239 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525327  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3063  poly(A) polymerase  25.74 
 
 
473 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0123  hypothetical protein  31 
 
 
255 aa  43.9  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131423  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1007  protein of unknown function DUF105  32.61 
 
 
386 aa  44.3  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0992  Adenosylcobinamide hydrolase  25 
 
 
288 aa  42.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>