34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1234 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1234  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.140849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2525  hypothetical protein  67.4 
 
 
229 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1958  hypothetical protein  53.51 
 
 
252 aa  184  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.617647  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4321  hypothetical protein  48.25 
 
 
228 aa  172  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4761  hypothetical protein  48.29 
 
 
238 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.462607  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1956  protein of unknown function DUF105  33.33 
 
 
245 aa  95.1  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0789026  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  29.77 
 
 
494 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3636  hypothetical protein  28.64 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2681  hypothetical protein  30.26 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525327  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2543  hypothetical protein  33.16 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0492  hypothetical protein  30.13 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0705  hypothetical protein  30.3 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.987141  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  29.82 
 
 
490 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1069  hypothetical protein  31.16 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482979  normal  0.873329 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2406  hypothetical protein  31.43 
 
 
219 aa  62  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4761  hypothetical protein  33.13 
 
 
241 aa  60.1  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529649  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2352  hypothetical protein  31.82 
 
 
297 aa  59.7  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1672  hypothetical protein  43.02 
 
 
307 aa  59.3  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0106952  hitchhiker  0.00000000163355 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1230  hypothetical protein  33.63 
 
 
282 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842222  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1386  hypothetical protein  33.33 
 
 
214 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.122063 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4452  hypothetical protein  31.09 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.815722  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0140  protein of unknown function DUF105  29.83 
 
 
241 aa  52.4  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.499226 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2424  protein of unknown function DUF105  40.22 
 
 
180 aa  50.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142271  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2500  Adenosylcobinamide hydrolase  31.91 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.024288  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1007  protein of unknown function DUF105  28.26 
 
 
386 aa  48.9  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1368  hypothetical protein  25.12 
 
 
213 aa  48.5  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0123  hypothetical protein  32.22 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131423  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1533  hypothetical protein  29.31 
 
 
337 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00901937 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0181  hypothetical protein  37.08 
 
 
296 aa  46.2  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.808143  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1295  protein of unknown function DUF105  34.83 
 
 
393 aa  43.9  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41325  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1086  hypothetical protein  40 
 
 
175 aa  43.1  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1556  hypothetical protein  24.15 
 
 
254 aa  42  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00339974  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1356  CbiZ domain protein  24.15 
 
 
255 aa  41.6  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0102  hypothetical protein  24.15 
 
 
254 aa  41.6  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00649949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>