14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1086 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1086  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  353  7.999999999999999e-97  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2424  protein of unknown function DUF105  63.95 
 
 		 180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142271  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0705  hypothetical protein  41.57 
 
 		 296 aa  53.9  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.987141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2352  hypothetical protein  35.05 
 
 		 297 aa  53.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1533  hypothetical protein  35.57 
 
 		 337 aa  53.5  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00901937 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2543  hypothetical protein  43.02 
 
 		 303 aa  51.2  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1958  hypothetical protein  50.91 
 
 		 252 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.617647  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2525  hypothetical protein  44.74 
 
 		 229 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0181  hypothetical protein  33 
 
 		 296 aa  44.3  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.808143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4761  hypothetical protein  34.44 
 
 		 238 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.462607  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1234  hypothetical protein  40.74 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.140849 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4321  hypothetical protein  35 
 
 		 228 aa  42.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1368  hypothetical protein  36.9 
 
 		 213 aa  42.4  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2681  hypothetical protein  38.55 
 
 		 239 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>