45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4321 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4321  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4761  hypothetical protein  90.78 
 
 		 238 aa  358  3e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.462607  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1234  hypothetical protein  46.93 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.140849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2525  hypothetical protein  48.8 
 
 		 229 aa  154  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1958  hypothetical protein  46.88 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.617647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1956  protein of unknown function DUF105  29.87 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0789026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3636  hypothetical protein  30.96 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2352  hypothetical protein  35.38 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  29.9 
 
 		 494 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0140  protein of unknown function DUF105  37.79 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.499226 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1230  hypothetical protein  39.36 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842222  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0492  hypothetical protein  36.05 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2500  Adenosylcobinamide hydrolase  34.48 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.024288  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  30.65 
 
 		 490 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1672  hypothetical protein  29.47 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0106952  hitchhiker  0.00000000163355 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2681  hypothetical protein  41.38 
 
 		 239 aa  62  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525327  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1007  protein of unknown function DUF105  30 
 
 		 386 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0705  hypothetical protein  28.85 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.987141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0181  hypothetical protein  29.57 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.808143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2838  Adenosylcobinamide hydrolase  33.33 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_69  CbiZ-like protein  27.56 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0249  hypothetical protein  27.6 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0363735  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1368  hypothetical protein  26.7 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1265  hypothetical protein  36.54 
 
 		 385 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00387767  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1295  protein of unknown function DUF105  27.37 
 
 		 393 aa  53.1  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4452  hypothetical protein  40.86 
 
 		 219 aa  52.8  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.815722  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0645  hypothetical protein  28.74 
 
 		 358 aa  51.6  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_002936  DET1556  hypothetical protein  26.64 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00339974  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0102  hypothetical protein  26.64 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00649949  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0993  hypothetical protein  26.64 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_591  CbiZ-like protein  36.17 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.78364  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2543  hypothetical protein  27.59 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1356  CbiZ domain protein  26.17 
 
 		 255 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0687  hypothetical protein  34.74 
 
 		 256 aa  48.9  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0653  hypothetical protein  34.74 
 
 		 256 aa  48.9  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0623  hypothetical protein  34.04 
 
 		 256 aa  48.5  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.728752  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1386  hypothetical protein  33.83 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.122063 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4761  hypothetical protein  33.09 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0271  hypothetical protein  33.15 
 
 		 372 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.826934  normal  0.0239452 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0123  hypothetical protein  34.09 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131423  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0314  hypothetical protein  25.7 
 
 		 260 aa  46.2  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1001  hypothetical protein  28.83 
 
 		 369 aa  45.8  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1165  hypothetical protein  25.23 
 
 		 260 aa  45.4  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.136432  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1086  hypothetical protein  35 
 
 		 175 aa  42.4  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2406  hypothetical protein  34.13 
 
 		 219 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>