26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2500 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2500  Adenosylcobinamide hydrolase  100 
 
 
243 aa  484  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.024288  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0992  Adenosylcobinamide hydrolase  50.58 
 
 
288 aa  221  8e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389903  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2838  Adenosylcobinamide hydrolase  54.1 
 
 
255 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0236  protein of unknown function DUF105  56.91 
 
 
248 aa  208  5e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.926355  normal  0.451743 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0140  protein of unknown function DUF105  50.63 
 
 
241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.499226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4321  hypothetical protein  34.48 
 
 
228 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4761  hypothetical protein  34.88 
 
 
241 aa  62.8  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529649  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0181  hypothetical protein  27.59 
 
 
296 aa  62  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.808143  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1368  hypothetical protein  31.03 
 
 
213 aa  61.6  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1386  hypothetical protein  45.65 
 
 
214 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.122063 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0705  hypothetical protein  30.39 
 
 
296 aa  60.1  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.987141  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1956  protein of unknown function DUF105  30.85 
 
 
245 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0789026  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3636  hypothetical protein  25.12 
 
 
200 aa  56.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4761  hypothetical protein  34.63 
 
 
238 aa  55.8  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.462607  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2352  hypothetical protein  30.33 
 
 
297 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2543  hypothetical protein  28.57 
 
 
303 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0492  hypothetical protein  31.79 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2681  hypothetical protein  37.89 
 
 
239 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525327  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2406  hypothetical protein  41.46 
 
 
219 aa  49.3  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1958  hypothetical protein  36.36 
 
 
252 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.617647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1069  hypothetical protein  41.46 
 
 
219 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482979  normal  0.873329 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1234  hypothetical protein  38.95 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.140849 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  27.86 
 
 
490 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2525  hypothetical protein  37.8 
 
 
229 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4452  hypothetical protein  28.41 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.815722  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0123  hypothetical protein  31.82 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>