38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0492 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0492  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  497  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4452  hypothetical protein  42.41 
 
 		 219 aa  171  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.815722  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1386  hypothetical protein  45.07 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.122063 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1069  hypothetical protein  44.59 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482979  normal  0.873329 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2406  hypothetical protein  43.64 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4761  hypothetical protein  40.18 
 
 		 241 aa  119  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  29.11 
 
 		 494 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1230  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842222  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  30.35 
 
 		 490 aa  69.3  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1956  protein of unknown function DUF105  28.76 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0789026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4321  hypothetical protein  36.05 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_002950  PG0645  hypothetical protein  31.58 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4761  hypothetical protein  37.65 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.462607  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2681  hypothetical protein  34.23 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2525  hypothetical protein  32.74 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_591  CbiZ-like protein  29.68 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.78364  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0687  hypothetical protein  31.15 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0653  hypothetical protein  31.15 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1295  protein of unknown function DUF105  32.26 
 
 		 393 aa  55.1  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1234  hypothetical protein  33.68 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.140849 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1368  hypothetical protein  30.54 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2500  Adenosylcobinamide hydrolase  31.79 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.024288  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0623  hypothetical protein  30.6 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.728752  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1265  hypothetical protein  31.69 
 
 		 385 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00387767  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1007  protein of unknown function DUF105  33.6 
 
 		 386 aa  50.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0181  hypothetical protein  40.21 
 
 		 296 aa  49.7  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.808143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0123  hypothetical protein  32.29 
 
 		 255 aa  49.3  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131423  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_76  adenosylcobinamide amidohydrolase, CbiZ  33.9 
 
 		 259 aa  48.9  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0242  hypothetical protein  33.9 
 
 		 259 aa  48.9  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0895738  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3636  hypothetical protein  28 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0249  hypothetical protein  31.9 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0363735  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2743  hypothetical protein  34.15 
 
 		 700 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_69  CbiZ-like protein  31.03 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0271  hypothetical protein  28.86 
 
 		 372 aa  45.8  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.826934  normal  0.0239452 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0140  protein of unknown function DUF105  32.8 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.499226 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1958  hypothetical protein  34.19 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.617647  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2543  hypothetical protein  30.54 
 
 		 303 aa  43.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2352  hypothetical protein  32 
 
 		 297 aa  42.7  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>