31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1356 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1356  CbiZ domain protein  100 
 
 		 255 aa  528  1e-149  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0314  hypothetical protein  93.33 
 
 		 260 aa  498  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1165  hypothetical protein  93.73 
 
 		 260 aa  499  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.136432  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0993  hypothetical protein  92.16 
 
 		 254 aa  489  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0102  hypothetical protein  91.76 
 
 		 254 aa  488  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00649949  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1556  hypothetical protein  91.37 
 
 		 254 aa  484  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00339974  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0242  hypothetical protein  48.4 
 
 		 259 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0895738  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_76  adenosylcobinamide amidohydrolase, CbiZ  48.4 
 
 		 259 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0623  hypothetical protein  49.79 
 
 		 256 aa  236  2e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.728752  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0653  hypothetical protein  49.36 
 
 		 256 aa  236  4e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0687  hypothetical protein  49.36 
 
 		 256 aa  236  4e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_591  CbiZ-like protein  48.93 
 
 		 256 aa  231  7.000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.78364  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_69  CbiZ-like protein  40.76 
 
 		 268 aa  191  9e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0249  hypothetical protein  41.18 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0363735  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0123  hypothetical protein  39.04 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131423  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1230  hypothetical protein  35.84 
 
 		 282 aa  131  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2743  hypothetical protein  32.03 
 
 		 700 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1001  hypothetical protein  34.23 
 
 		 369 aa  87  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1295  protein of unknown function DUF105  37.21 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41325  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0645  hypothetical protein  33.93 
 
 		 358 aa  82  0.000000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1265  hypothetical protein  34.13 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00387767  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0271  hypothetical protein  31.17 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.826934  normal  0.0239452 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1007  protein of unknown function DUF105  36.75 
 
 		 386 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  31.95 
 
 		 494 aa  62.4  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  29.7 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4321  hypothetical protein  26.17 
 
 		 228 aa  49.3  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1956  protein of unknown function DUF105  34.59 
 
 		 245 aa  48.9  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0789026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2681  hypothetical protein  30.32 
 
 		 239 aa  45.8  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525327  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3636  hypothetical protein  28.17 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4761  hypothetical protein  26.92 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.462607  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1386  hypothetical protein  26.96 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.122063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>