41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1295 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1295  protein of unknown function DUF105  100 
 
 
393 aa  813    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41325  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1007  protein of unknown function DUF105  65.71 
 
 
386 aa  520  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1265  hypothetical protein  53.05 
 
 
385 aa  363  3e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00387767  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0271  hypothetical protein  40.19 
 
 
372 aa  226  7e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.826934  normal  0.0239452 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1001  hypothetical protein  38.78 
 
 
369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0645  hypothetical protein  34.17 
 
 
358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1230  hypothetical protein  37.8 
 
 
282 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2743  hypothetical protein  30.86 
 
 
700 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0623  hypothetical protein  40.57 
 
 
256 aa  106  8e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.728752  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_591  CbiZ-like protein  41.71 
 
 
256 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.78364  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0687  hypothetical protein  41.14 
 
 
256 aa  103  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0653  hypothetical protein  41.14 
 
 
256 aa  103  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0123  hypothetical protein  33.47 
 
 
255 aa  103  6e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131423  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0242  hypothetical protein  36 
 
 
259 aa  90.5  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0895738  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_76  adenosylcobinamide amidohydrolase, CbiZ  36.42 
 
 
259 aa  90.1  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0102  hypothetical protein  37.21 
 
 
254 aa  90.1  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00649949  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0993  hypothetical protein  37.21 
 
 
254 aa  89.7  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1165  hypothetical protein  37.21 
 
 
260 aa  89  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.136432  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0249  hypothetical protein  30.21 
 
 
268 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0363735  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1556  hypothetical protein  36.63 
 
 
254 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00339974  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0314  hypothetical protein  36.63 
 
 
260 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_69  CbiZ-like protein  29.79 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1356  CbiZ domain protein  37.21 
 
 
255 aa  84  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1956  protein of unknown function DUF105  35.9 
 
 
245 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0789026  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  34.59 
 
 
490 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  29.57 
 
 
494 aa  66.2  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0492  hypothetical protein  32.26 
 
 
250 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4321  hypothetical protein  27.37 
 
 
228 aa  53.1  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2681  hypothetical protein  39.33 
 
 
239 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525327  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4761  hypothetical protein  40.91 
 
 
241 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529649  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4761  hypothetical protein  31.91 
 
 
238 aa  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.462607  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1368  hypothetical protein  27.49 
 
 
213 aa  48.5  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4452  hypothetical protein  34.96 
 
 
219 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.815722  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1386  hypothetical protein  36.54 
 
 
214 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.122063 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2352  hypothetical protein  24.07 
 
 
297 aa  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3636  hypothetical protein  27.03 
 
 
200 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2525  hypothetical protein  32.22 
 
 
229 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1069  hypothetical protein  37.5 
 
 
219 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482979  normal  0.873329 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2406  hypothetical protein  37.5 
 
 
219 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2543  hypothetical protein  27.23 
 
 
303 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1234  hypothetical protein  34.83 
 
 
234 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.140849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>