33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0645 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0645  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  738    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0271  hypothetical protein  37.11 
 
 		 372 aa  203  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.826934  normal  0.0239452 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1001  hypothetical protein  34.33 
 
 		 369 aa  184  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1295  protein of unknown function DUF105  34.17 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1007  protein of unknown function DUF105  34.2 
 
 		 386 aa  170  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1265  hypothetical protein  37.79 
 
 		 385 aa  162  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00387767  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1230  hypothetical protein  36.52 
 
 		 282 aa  99  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842222  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0123  hypothetical protein  28.45 
 
 		 255 aa  87.4  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131423  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0623  hypothetical protein  35.4 
 
 		 256 aa  86.7  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.728752  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1165  hypothetical protein  34.59 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.136432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2743  hypothetical protein  31.22 
 
 		 700 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0687  hypothetical protein  34.78 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0653  hypothetical protein  34.78 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_591  CbiZ-like protein  34.78 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.78364  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0314  hypothetical protein  33.96 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1356  CbiZ domain protein  33.93 
 
 		 255 aa  82  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1556  hypothetical protein  34.64 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00339974  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  33.72 
 
 		 494 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0102  hypothetical protein  35.29 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00649949  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0993  hypothetical protein  35.29 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_76  adenosylcobinamide amidohydrolase, CbiZ  31.03 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0242  hypothetical protein  31.03 
 
 		 259 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0895738  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_69  CbiZ-like protein  34.78 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  33.33 
 
 		 490 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1956  protein of unknown function DUF105  34.78 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0789026  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0249  hypothetical protein  34.78 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0363735  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0492  hypothetical protein  31.58 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2681  hypothetical protein  29.22 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525327  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4321  hypothetical protein  28.74 
 
 		 228 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1386  hypothetical protein  36.36 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.122063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4761  hypothetical protein  25.53 
 
 		 238 aa  46.6  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.462607  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4761  hypothetical protein  31.58 
 
 		 241 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2352  hypothetical protein  28.1 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>