32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_69 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_69  CbiZ-like protein  100 
 
 		 268 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0249  hypothetical protein  97.39 
 
 		 268 aa  544  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0363735  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0653  hypothetical protein  45.27 
 
 		 256 aa  218  7e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0687  hypothetical protein  45.27 
 
 		 256 aa  218  7e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0623  hypothetical protein  46.09 
 
 		 256 aa  218  7.999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.728752  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_591  CbiZ-like protein  45.27 
 
 		 256 aa  215  7e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.78364  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0314  hypothetical protein  43.28 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1165  hypothetical protein  42.86 
 
 		 260 aa  202  6e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.136432  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0993  hypothetical protein  41.18 
 
 		 254 aa  193  3e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0102  hypothetical protein  40.76 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00649949  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1556  hypothetical protein  40.76 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00339974  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1356  CbiZ domain protein  40.76 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0242  hypothetical protein  39.57 
 
 		 259 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0895738  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_76  adenosylcobinamide amidohydrolase, CbiZ  39.57 
 
 		 259 aa  172  5e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0123  hypothetical protein  34.48 
 
 		 255 aa  142  8e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131423  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1230  hypothetical protein  37.67 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2743  hypothetical protein  31.91 
 
 		 700 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1295  protein of unknown function DUF105  29.79 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1007  protein of unknown function DUF105  33.05 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1265  hypothetical protein  35.58 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00387767  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1001  hypothetical protein  35.53 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0645  hypothetical protein  34.78 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0271  hypothetical protein  32.45 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.826934  normal  0.0239452 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  31.84 
 
 		 494 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4321  hypothetical protein  27.56 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4761  hypothetical protein  28.57 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.462607  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2543  hypothetical protein  30.77 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  28.26 
 
 		 490 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0492  hypothetical protein  31.03 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3636  hypothetical protein  25 
 
 		 200 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1956  protein of unknown function DUF105  30.17 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0789026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2681  hypothetical protein  35.78 
 
 		 239 aa  42.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>