39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1007 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1007  protein of unknown function DUF105  100 
 
 
386 aa  796    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1295  protein of unknown function DUF105  65.71 
 
 
393 aa  520  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41325  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1265  hypothetical protein  53.83 
 
 
385 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00387767  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1001  hypothetical protein  37.27 
 
 
369 aa  195  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0271  hypothetical protein  37.81 
 
 
372 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.826934  normal  0.0239452 
 
 
-
 
NC_002950  PG0645  hypothetical protein  34.2 
 
 
358 aa  170  5e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.636472 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1230  hypothetical protein  39.11 
 
 
282 aa  117  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2743  hypothetical protein  31.95 
 
 
700 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0123  hypothetical protein  32.08 
 
 
255 aa  97.8  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131423  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0653  hypothetical protein  42.58 
 
 
256 aa  93.2  7e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0687  hypothetical protein  42.58 
 
 
256 aa  93.2  7e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_591  CbiZ-like protein  42.58 
 
 
256 aa  92.8  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.78364  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0623  hypothetical protein  42.58 
 
 
256 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.728752  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0249  hypothetical protein  31.78 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0363735  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_69  CbiZ-like protein  33.05 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0102  hypothetical protein  36.42 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00649949  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0993  hypothetical protein  36.42 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0242  hypothetical protein  31.09 
 
 
259 aa  82  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0895738  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_76  adenosylcobinamide amidohydrolase, CbiZ  31.58 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1556  hypothetical protein  35.84 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00339974  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1956  protein of unknown function DUF105  34.23 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0789026  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1356  CbiZ domain protein  36.75 
 
 
255 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  30.94 
 
 
490 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0314  hypothetical protein  36.75 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1165  hypothetical protein  36.14 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.136432  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  28.95 
 
 
494 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4761  hypothetical protein  27.03 
 
 
238 aa  60.1  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.462607  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4321  hypothetical protein  30 
 
 
228 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.080776 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2352  hypothetical protein  26.6 
 
 
297 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4761  hypothetical protein  42.05 
 
 
241 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529649  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2681  hypothetical protein  29.67 
 
 
239 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525327  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1069  hypothetical protein  39.33 
 
 
219 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482979  normal  0.873329 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2406  hypothetical protein  39.33 
 
 
219 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0492  hypothetical protein  33.6 
 
 
250 aa  50.4  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1386  hypothetical protein  37.5 
 
 
214 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.122063 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4452  hypothetical protein  37.89 
 
 
219 aa  47.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.815722  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1958  hypothetical protein  28.12 
 
 
252 aa  47  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.617647  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1672  hypothetical protein  32.61 
 
 
307 aa  44.3  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0106952  hitchhiker  0.00000000163355 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1234  hypothetical protein  35.56 
 
 
234 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.140849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>