17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2979 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2979  cysteine-rich small domain protein  100 
 
 
101 aa  206  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21220  cobalamin biosynthesis protein CbiD  44 
 
 
481 aa  89.4  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.982335  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0070  cysteine-rich small domain protein  40.23 
 
 
95 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  44.26 
 
 
498 aa  59.7  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3547  hypothetical protein  46.88 
 
 
115 aa  53.9  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1186  hypothetical protein  40.24 
 
 
111 aa  53.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2921  hypothetical protein  33.98 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.181505  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0101  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.35 
 
 
341 aa  52.4  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4258  hypothetical protein  38.82 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3280  hypothetical protein  37.65 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  47.27 
 
 
496 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3448  hypothetical protein  42.19 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal  0.183799 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3562  hypothetical protein  39.13 
 
 
125 aa  47.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.19448  normal  0.42106 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1672  hypothetical protein  41.51 
 
 
307 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0106952  hitchhiker  0.00000000163355 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  40 
 
 
498 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1233  hypothetical protein  37.5 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1244  hypothetical protein  40.62 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>