10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2921 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2921  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  254  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.181505  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3280  hypothetical protein  89.81 
 
 		 108 aa  213  8e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4258  hypothetical protein  84.26 
 
 		 111 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1186  hypothetical protein  80.56 
 
 		 111 aa  191  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3547  hypothetical protein  82.47 
 
 		 115 aa  181  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3448  hypothetical protein  80.41 
 
 		 127 aa  175  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal  0.183799 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3562  hypothetical protein  78.35 
 
 		 125 aa  169  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.19448  normal  0.42106 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21220  cobalamin biosynthesis protein CbiD  43.28 
 
 		 481 aa  64.3  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.982335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2979  cysteine-rich small domain protein  33.98 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0070  cysteine-rich small domain protein  44.26 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>