More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1049 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1049  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
405 aa  808    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239765  normal  0.0805171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6321  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  57.7 
 
 
383 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.249622  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3095  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.79 
 
 
397 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3276  acyl-CoA dehydrogenase-like  59.38 
 
 
382 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.863338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4469  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.53 
 
 
389 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.029664  normal  0.327843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0824  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.03 
 
 
393 aa  317  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.294014  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2115  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.3 
 
 
404 aa  315  8e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.874922 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3948  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.15 
 
 
391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0664421 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3835  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.15 
 
 
391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.588687 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2278  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  44.42 
 
 
390 aa  311  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1327  acyl-CoA dehydrogenase-like  45.85 
 
 
383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3176  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.35 
 
 
389 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.678758 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2239  acyl-CoA dehydrogenase-like  45.53 
 
 
384 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.708615  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2181  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  45.55 
 
 
389 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.594963  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0278  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.56 
 
 
402 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4072  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.17 
 
 
401 aa  299  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7164  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.21 
 
 
402 aa  298  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647387  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02011  acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  46.07 
 
 
399 aa  297  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4885  Butyryl-CoA dehydrogenase  47.96 
 
 
413 aa  295  8e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0885912 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4017  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.08 
 
 
391 aa  291  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7841  putative acyl-CoA dehydrogenase  44.3 
 
 
398 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0226224  normal  0.324634 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2199  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  46.34 
 
 
388 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00319819  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2691  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.31 
 
 
391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602667  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1203  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.82 
 
 
381 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.52 
 
 
378 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.580305  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0496  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.32 
 
 
411 aa  243  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.249312  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5041  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.16 
 
 
397 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3620  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.4 
 
 
393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.404533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4400  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.94 
 
 
394 aa  230  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0590  acyl-CoA dehydrogenase-like  37.5 
 
 
414 aa  216  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.882446  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5525  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.53 
 
 
397 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3931  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.19 
 
 
400 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.543045 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.41 
 
 
381 aa  209  5e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1436  butyryl-CoA dehydrogenase  35.71 
 
 
410 aa  209  7e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.170652  hitchhiker  0.00553945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2160  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.12 
 
 
391 aa  206  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.828679 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0539  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.03 
 
 
405 aa  206  7e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00283131 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0456  butyryl-CoA dehydrogenase  35.57 
 
 
410 aa  204  2e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.820933  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.37 
 
 
386 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4730  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.31 
 
 
376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.73 
 
 
382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3052  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.99 
 
 
376 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3774  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.99 
 
 
376 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0268  butyryl-CoA dehydrogenase  33.62 
 
 
379 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1300  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  35.01 
 
 
388 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1317  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.01 
 
 
388 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1336  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.01 
 
 
388 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11867  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4353  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.62 
 
 
385 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  37.98 
 
 
379 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  37.98 
 
 
379 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  37.98 
 
 
379 aa  193  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3174  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.54 
 
 
383 aa  193  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000929019  hitchhiker  0.000000000938929 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  37.98 
 
 
379 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3838  acyl-CoA dehydrogenase-like  35.24 
 
 
376 aa  193  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.72 
 
 
375 aa  193  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285028  normal  0.547313 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  37.63 
 
 
379 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  37.63 
 
 
379 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  37.63 
 
 
379 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1570  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.71 
 
 
383 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2906  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.52 
 
 
375 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  36.59 
 
 
379 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0391  acyl-CoA dehydrogenase  36.87 
 
 
375 aa  191  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.31925  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4743  butyryl-CoA dehydrogenase  31.95 
 
 
417 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0838  butyryl-CoA dehydrogenase  36.21 
 
 
410 aa  191  2e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0447  acyl-CoA dehydrogenase  36.87 
 
 
375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1777  putative acyl-CoA dehydrogenase  39.3 
 
 
383 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0345355  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1179  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  34.79 
 
 
392 aa  191  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2176  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.99 
 
 
380 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.96 
 
 
377 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  36.59 
 
 
379 aa  190  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.74 
 
 
382 aa  190  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4365  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.31 
 
 
376 aa  190  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.82 
 
 
379 aa  190  5e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.24 
 
 
379 aa  189  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4257  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.16 
 
 
376 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2476  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.96 
 
 
380 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.185436 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0459  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.63 
 
 
376 aa  190  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.672922 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.28 
 
 
380 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1288  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.04 
 
 
379 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.751821 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4384  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.33 
 
 
375 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17615  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1029  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.23 
 
 
387 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1719  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.69 
 
 
389 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0459  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.03 
 
 
376 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1058  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.23 
 
 
386 aa  188  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.405365  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.24 
 
 
379 aa  188  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2901  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.52 
 
 
379 aa  188  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.6 
 
 
394 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.954368  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5985  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.71 
 
 
376 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997774 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.71 
 
 
379 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.12 
 
 
380 aa  187  4e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.52 
 
 
381 aa  186  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.28 
 
 
379 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3882  butyryl-CoA dehydrogenase  39.49 
 
 
395 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4185  acyl-CoA dehydrogenase-like  34.08 
 
 
376 aa  186  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.15 
 
 
380 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.81 
 
 
380 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.25 
 
 
379 aa  186  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.394739 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1526  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.42 
 
 
404 aa  186  8e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.84855  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2548  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.69 
 
 
375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1175  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.76 
 
 
381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1165  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.49 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>