More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1595 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4377  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  77.6 
 
 
433 aa  639    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1595  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  100 
 
 
433 aa  861    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.472132  normal  0.884744 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2634  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  75.52 
 
 
433 aa  626  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.206684  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3490  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.44 
 
 
436 aa  550  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1240  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.9 
 
 
435 aa  546  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.543485 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0841  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.59 
 
 
434 aa  545  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3266  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.9 
 
 
435 aa  542  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2079  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.83 
 
 
434 aa  540  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3441  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.68 
 
 
437 aa  540  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.37686  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2851  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.14 
 
 
436 aa  535  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192992  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1999  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.37 
 
 
434 aa  534  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.432724  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2296  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.98 
 
 
435 aa  532  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.238027 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5465  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.06 
 
 
437 aa  531  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0257  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.75 
 
 
437 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0116604 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0031  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.74 
 
 
435 aa  525  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3600  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.51 
 
 
435 aa  525  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00234742  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0251  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.29 
 
 
435 aa  526  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.600656  normal  0.544782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0624  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.67 
 
 
437 aa  528  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.770577 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0129  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.05 
 
 
433 aa  524  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.768224  normal  0.321326 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0120  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  62.96 
 
 
433 aa  522  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.417089  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3983  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.51 
 
 
435 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0656  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.98 
 
 
437 aa  522  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2983  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.75 
 
 
435 aa  523  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2790  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.68 
 
 
435 aa  524  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3084  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.59 
 
 
437 aa  520  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0435809  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0302  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.13 
 
 
434 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0645  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.52 
 
 
437 aa  521  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883439  normal  0.159408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4311  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.05 
 
 
435 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0308  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  62.82 
 
 
433 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1532  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  62.96 
 
 
433 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0403  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.51 
 
 
433 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.236378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0418  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.74 
 
 
433 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0182  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  62.96 
 
 
433 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1260  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.75 
 
 
436 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0152  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  62.67 
 
 
434 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2948  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  62.27 
 
 
433 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.474337  normal  0.124858 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2559  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.53 
 
 
437 aa  510  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.358535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0057  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  60.59 
 
 
444 aa  505  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408482  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0187  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.01 
 
 
438 aa  506  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0444321  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3708  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.22 
 
 
443 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3083  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.75 
 
 
438 aa  500  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0175697 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3385  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.78 
 
 
443 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0168  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.68 
 
 
443 aa  500  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3522  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.18 
 
 
442 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0433  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.18 
 
 
442 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3700  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.18 
 
 
442 aa  500  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62855  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4163  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.77 
 
 
440 aa  496  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3782  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.09 
 
 
441 aa  498  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.268349  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2546  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.96 
 
 
443 aa  495  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0440  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.41 
 
 
441 aa  494  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0528  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.73 
 
 
442 aa  495  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0132  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.86 
 
 
439 aa  498  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0500755 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2990  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.11 
 
 
446 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0446  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.28 
 
 
442 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4370  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.6 
 
 
443 aa  493  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0374  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.86 
 
 
441 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.191094  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3838  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58 
 
 
451 aa  493  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.672147 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2341  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.96 
 
 
447 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.320663  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4430  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.95 
 
 
441 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.193952  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0811  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.4 
 
 
438 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.908147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3680  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.11 
 
 
446 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3765  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.41 
 
 
441 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000246667  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0530  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.18 
 
 
441 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.10008  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5001  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.06 
 
 
447 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0042  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.1 
 
 
443 aa  490  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3868  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.05 
 
 
442 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0472  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.05 
 
 
442 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4875  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.06 
 
 
447 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129232  normal  0.155967 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0462  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.05 
 
 
442 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3362  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.95 
 
 
441 aa  491  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0909  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.14 
 
 
442 aa  491  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5051  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.06 
 
 
447 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4129  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.36 
 
 
440 aa  491  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000086324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0463  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.28 
 
 
447 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0394  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.88 
 
 
445 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.934917  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0204  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.66 
 
 
446 aa  486  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337304  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1460  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.27 
 
 
445 aa  487  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4381  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.52 
 
 
448 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0342  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.3 
 
 
448 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45390  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.65 
 
 
446 aa  485  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0072  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.84 
 
 
447 aa  484  1e-135  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5141  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  59.42 
 
 
445 aa  481  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4104  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.56 
 
 
443 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3798  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  57.01 
 
 
443 aa  484  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3390  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.46 
 
 
448 aa  483  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0502353 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0164  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.3 
 
 
447 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121323  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0112  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.56 
 
 
443 aa  484  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5052  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.58 
 
 
431 aa  482  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42386  normal  0.164562 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0112  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.56 
 
 
443 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2114  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.06 
 
 
465 aa  484  1e-135  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2015  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.09 
 
 
440 aa  481  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.788051  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0404  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.69 
 
 
440 aa  478  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0953822  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0817  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.11 
 
 
443 aa  481  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.544231  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4192  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.47 
 
 
443 aa  479  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0067  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.4 
 
 
440 aa  479  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0003  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.92 
 
 
444 aa  478  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.834513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4373  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.24 
 
 
443 aa  479  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4467  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.24 
 
 
443 aa  478  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4042  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.24 
 
 
443 aa  480  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1409  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.82 
 
 
439 aa  481  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>