More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0132 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0342  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  78.2 
 
 		 448 aa  708    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0042  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  91.8 
 
 		 443 aa  817    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2915  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  78.15 
 
 		 447 aa  689    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0909  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.82 
 
 		 442 aa  647    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0069  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  79.05 
 
 		 447 aa  699    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234013  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3253  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  78.15 
 
 		 447 aa  689    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198365  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0204  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  73.59 
 
 		 446 aa  660    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0168  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  94.76 
 
 		 443 aa  849    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0385  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  78.38 
 
 		 447 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333539  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3087  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  78.83 
 
 		 447 aa  690    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0225725 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3680  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  74.04 
 
 		 446 aa  673    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6442  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  78.15 
 
 		 447 aa  688    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3109  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  78.83 
 
 		 447 aa  691    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104887 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3385  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  91.34 
 
 		 443 aa  813    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3433  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  78.15 
 
 		 447 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4560  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  76.54 
 
 		 441 aa  687    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2546  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  72.95 
 
 		 443 aa  659    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0164  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  78.38 
 
 		 447 aa  709    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121323  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3001  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  78.15 
 
 		 447 aa  689    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259081 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0789  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  74.66 
 
 		 445 aa  664    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.312061  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3435  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  72.95 
 
 		 440 aa  662    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.341548  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2990  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  73.59 
 
 		 446 aa  672    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0200  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  78.15 
 
 		 447 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.947608  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1460  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  72.21 
 
 		 445 aa  657    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4381  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  78.2 
 
 		 448 aa  707    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0132  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  100 
 
 		 439 aa  887    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0500755 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2174  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  78.15 
 
 		 447 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.715778  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2478  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  78.83 
 
 		 447 aa  691    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0166011  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3139  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  77.93 
 
 		 447 aa  685    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3708  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  91.57 
 
 		 443 aa  815    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0190  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  78.15 
 
 		 447 aa  689    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3092  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  78.83 
 
 		 447 aa  691    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.486059  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0811  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  73.35 
 
 		 438 aa  662    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.908147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3390  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.97 
 
 		 448 aa  630  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502353 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2542  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  71.3 
 
 		 438 aa  621  1e-177  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0057  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  68.78 
 
 		 444 aa  624  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408482  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3838  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.82 
 
 		 451 aa  624  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.672147 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45390  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.52 
 
 		 446 aa  615  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5001  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.59 
 
 		 447 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5051  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.59 
 
 		 447 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5141  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  67.64 
 
 		 445 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0394  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  67.19 
 
 		 445 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.934917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0817  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  67.95 
 
 		 443 aa  609  1e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.544231  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4875  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.59 
 
 		 447 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129232  normal  0.155967 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0695  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.71 
 
 		 441 aa  605  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0678  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.71 
 
 		 441 aa  605  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0396  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.76 
 
 		 445 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1542  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.31 
 
 		 443 aa  605  9.999999999999999e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4370  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.21 
 
 		 443 aa  598  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0179  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.68 
 
 		 443 aa  599  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.763175  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0374  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.06 
 
 		 441 aa  599  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.191094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0463  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.47 
 
 		 447 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0113  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  65.08 
 
 		 443 aa  599  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0446  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.15 
 
 		 442 aa  594  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0112  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.55 
 
 		 443 aa  595  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0532  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.47 
 
 		 446 aa  597  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0112  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.55 
 
 		 443 aa  595  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3782  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.6 
 
 		 441 aa  596  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.268349  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3798  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  65.08 
 
 		 443 aa  595  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4104  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.55 
 
 		 443 aa  595  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4129  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.86 
 
 		 440 aa  597  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000086324 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2247  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.14 
 
 		 443 aa  596  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2015  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.38 
 
 		 440 aa  592  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.788051  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0530  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.69 
 
 		 441 aa  593  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.10008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0404  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.68 
 
 		 440 aa  592  1e-168  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0953822  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0165  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.23 
 
 		 443 aa  593  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0462  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.69 
 
 		 442 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0472  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.69 
 
 		 442 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0433  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.46 
 
 		 442 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3868  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.69 
 
 		 442 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0440  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.38 
 
 		 441 aa  590  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0115  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  66.74 
 
 		 444 aa  588  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.928834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4793  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.4 
 
 		 444 aa  588  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000260414 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4373  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.55 
 
 		 443 aa  589  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5791  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.29 
 
 		 447 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1324  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  66.22 
 
 		 446 aa  591  1e-167  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3362  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.6 
 
 		 441 aa  590  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4413  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.55 
 
 		 443 aa  590  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.137212  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3522  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.46 
 
 		 442 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0067  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.82 
 
 		 440 aa  590  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66790  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.07 
 
 		 447 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5388  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.55 
 
 		 443 aa  590  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3700  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.46 
 
 		 442 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62855  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03816  ATP-dependent protease ATP-binding subunit  64.32 
 
 		 443 aa  587  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4054  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  64.32 
 
 		 443 aa  587  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4163  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.46 
 
 		 440 aa  586  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2739  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.71 
 
 		 444 aa  587  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4163  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.32 
 
 		 443 aa  587  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4491  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.86 
 
 		 443 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4337  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.86 
 
 		 443 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.321775  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4421  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.86 
 
 		 443 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4423  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.86 
 
 		 443 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4467  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.32 
 
 		 443 aa  587  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4307  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.86 
 
 		 443 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.114857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0528  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.46 
 
 		 442 aa  587  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001749  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  65.45 
 
 		 443 aa  586  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28369  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03765  hypothetical protein  64.32 
 
 		 443 aa  587  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4042  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.17 
 
 		 443 aa  584  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4087  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.32 
 
 		 443 aa  587  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00723  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.23 
 
 		 443 aa  584  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>