More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3441 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2790  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  80.32 
 
 
435 aa  707    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1532  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  81.24 
 
 
433 aa  714    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2948  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  81.01 
 
 
433 aa  709    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.474337  normal  0.124858 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0182  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  81.24 
 
 
433 aa  714    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0187  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  81.32 
 
 
438 aa  701    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0444321  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2851  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  84.7 
 
 
436 aa  747    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192992  normal  0.735765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3441  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  100 
 
 
437 aa  880    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.37686  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3266  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  68.65 
 
 
435 aa  610  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1240  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.59 
 
 
435 aa  601  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.543485 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3983  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  67.73 
 
 
435 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4311  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  67.51 
 
 
435 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0031  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.82 
 
 
435 aa  588  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2296  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.68 
 
 
435 aa  584  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.238027 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3490  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.67 
 
 
436 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2079  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.9 
 
 
434 aa  578  1e-164  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0841  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.13 
 
 
434 aa  580  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0129  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.9 
 
 
433 aa  580  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.768224  normal  0.321326 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2983  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.22 
 
 
435 aa  580  1e-164  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0308  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  67.12 
 
 
433 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0120  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.68 
 
 
433 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.417089  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1999  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.45 
 
 
434 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.432724  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0251  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  62.93 
 
 
435 aa  574  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.600656  normal  0.544782 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0302  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.36 
 
 
434 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0152  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.22 
 
 
434 aa  570  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3600  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.22 
 
 
435 aa  570  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00234742  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0418  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.98 
 
 
433 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0403  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.53 
 
 
433 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.236378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5465  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.15 
 
 
437 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0656  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.83 
 
 
437 aa  557  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0257  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.69 
 
 
437 aa  557  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0116604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0624  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  66.14 
 
 
437 aa  556  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.770577 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0645  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  65.6 
 
 
437 aa  556  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883439  normal  0.159408 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3084  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.77 
 
 
437 aa  548  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0435809  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2559  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.46 
 
 
437 aa  543  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.358535 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1260  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  62.99 
 
 
436 aa  543  1e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3782  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.73 
 
 
441 aa  525  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.268349  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3083  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.47 
 
 
438 aa  525  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0175697 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2015  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  60.22 
 
 
440 aa  523  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.788051  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1595  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.68 
 
 
433 aa  523  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.472132  normal  0.884744 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0530  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.3 
 
 
441 aa  518  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.10008  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0015  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.3 
 
 
461 aa  516  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4430  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.39 
 
 
441 aa  513  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.193952  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0374  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.07 
 
 
441 aa  511  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.191094  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3362  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.84 
 
 
441 aa  511  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0433  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.17 
 
 
442 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0057  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  59.33 
 
 
444 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408482  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3700  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.94 
 
 
442 aa  511  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62855  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0204  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.87 
 
 
446 aa  509  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337304  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0168  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.91 
 
 
443 aa  508  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3708  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.78 
 
 
443 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4377  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  63.84 
 
 
433 aa  509  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3522  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.94 
 
 
442 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0067  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.33 
 
 
440 aa  510  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0528  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.72 
 
 
442 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4163  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.75 
 
 
440 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3385  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.78 
 
 
443 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2412  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.35 
 
 
445 aa  504  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.874746  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2114  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.2 
 
 
465 aa  504  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0072  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.42 
 
 
447 aa  508  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0132  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.01 
 
 
439 aa  507  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0500755 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03816  ATP-dependent protease ATP-binding subunit  57.59 
 
 
443 aa  502  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4054  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  57.59 
 
 
443 aa  502  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03765  hypothetical protein  57.59 
 
 
443 aa  502  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4413  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.59 
 
 
443 aa  501  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.137212  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0042  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.56 
 
 
443 aa  503  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5388  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.59 
 
 
443 aa  503  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4370  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.04 
 
 
443 aa  503  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3868  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.82 
 
 
442 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0462  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.82 
 
 
442 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4087  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.59 
 
 
443 aa  502  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4163  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.59 
 
 
443 aa  502  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5052  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  64.76 
 
 
431 aa  504  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42386  normal  0.164562 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2546  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.37 
 
 
443 aa  502  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1409  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  61.7 
 
 
439 aa  502  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4373  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.59 
 
 
443 aa  501  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611238 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0472  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.82 
 
 
442 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0599  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.73 
 
 
441 aa  501  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711171  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3765  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.85 
 
 
441 aa  504  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000246667  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0446  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.82 
 
 
442 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0695  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.01 
 
 
441 aa  500  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0678  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.01 
 
 
441 aa  500  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0789  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58 
 
 
445 aa  499  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.312061  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04279  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.84 
 
 
485 aa  501  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0113  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  56.92 
 
 
443 aa  498  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4042  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.92 
 
 
443 aa  499  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4467  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  57.37 
 
 
443 aa  499  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0440  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.3 
 
 
441 aa  500  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4192  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  58.26 
 
 
443 aa  501  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4307  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.7 
 
 
443 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.114857  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4423  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.7 
 
 
443 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0342  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.95 
 
 
448 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0805  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  54.23 
 
 
492 aa  496  1e-139  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.332648  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4491  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.7 
 
 
443 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4421  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.7 
 
 
443 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732607  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0112  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.92 
 
 
443 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0817  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.98 
 
 
443 aa  498  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.544231  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4337  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.7 
 
 
443 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.321775  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0532  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  59.56 
 
 
446 aa  495  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0112  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.92 
 
 
443 aa  496  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4104  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  56.92 
 
 
443 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>